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目的:通过在公共数据库癌症基因图谱(The cancer genome atlas,TCGA)中提取RNA序列数据(RNA-seq)进行分析,挖掘结直肠癌预后相关的关键LncRNA,并利用细胞学研究验证。为进一步的机制研究提供依据,进而探索对结直肠癌患者具有诊断及预后判断意义的LncRNA。方法:下载肿瘤基因图谱(TCGA)数据库中CRC相关的647例CRC和51例癌旁组织RNA-seq数据,利用Perl提取LncRNA的矩阵,通过对存在差异表达的LncRNA进行批量生存分析,从而筛选出存在显著意义的目标LncRNA进行下一步验证;通过分析癌与癌旁组织中上述目标LncRNA的表达水平,比较并验证目标LncRNA表达水平的差异性;对目标LncRNA行基因功能、通路富集分析;通过生物信息学技术分析预测可能存在的此目标LncRNA与靶基因的调控关系,初步阐明此目标LncRNA在CRC患者诊断及预后中发挥的作用。培养HCT116、SW620、SW480、HT29细胞株,并分别进行了 qRT-PCR实验检测4个细胞系中目标Lnc RNA的表达水平;设计能特异性抑制目标LncRNA表达的siRNA(Small interfering RNA;siRNA)片段,检测其干扰效率;分别转染相应细胞后,进行CCK8、划痕及transwel实验,观察其细胞行为的改变,判断目标LncRNA对上述细胞增殖、迁移、侵袭的影响。结果:利用生物信息学技术分析并筛选出存在预后显著性意义且差异表达的LncRNA-CLDN10-AS1,经过数据库分析CLDN10-AS1在CRC组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.001)。对基因富集性分析发现,LncRNA CLDN10-AS1参与细胞的多个生物学行为。4个细胞系中HT29、SW480具有相对较高的CLDN10-AS1 表达水平(P<0.05)。序 列 为5’-CACCGCTGAGCATGT.GGGTCCTTATCGAAATAAGGACCCACATGCTCAG C-3’的siRNA具有明显的基因沉默效率(P<0.05),成功合成CLDN10-AS1 siRNA,通过RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术抑制 CLDN10-AS1 的表达后,SW480、HT29细胞的增殖、侵袭、迁移能力显著降低(p<0.05)。结论:1.结直肠癌组织中存在大量的LncRNA表达差异,与肿瘤的发生、发展密切相关,其中CLDN10-AS1在结直肠癌组织中表达显著增高,提示患者的预后不良。2.生物信息学技术分析提示LncRNA CLDN10-AS1在CRC发生发展过程中扮演重要角色,并与多个生物学行为有关。可为CRC患者预后判断及相关实验设计提供指导。3.通过CRC细胞实验验证表明CLDN10-AS1具有促进结直肠癌细胞SW480及HT29侵袭、增殖、迁移的作用,起着类似促癌基因的作用,在患者诊断、预后判断及临床治疗中具有潜在的意义。