【摘 要】
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羊具有很高的食用和使用价值。近年来,人们对肉制品、奶制品需求量的增加直接带动了畜牧业的发展,目前,规模养殖已经成为养羊业的主流。随着羊产业饲养密度的增大,羊病的发生率也在同步增长,病毒感染是导致羊患病的重要原因之一。羊病毒种类繁多,如小反刍兽疫病毒（Peste des petits ruminants virus,PPRV）、绵羊肺腺瘤病病毒（Jaagsiekte sheep retrovirus
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羊具有很高的食用和使用价值。近年来,人们对肉制品、奶制品需求量的增加直接带动了畜牧业的发展,目前,规模养殖已经成为养羊业的主流。随着羊产业饲养密度的增大,羊病的发生率也在同步增长,病毒感染是导致羊患病的重要原因之一。羊病毒种类繁多,如小反刍兽疫病毒（Peste des petits ruminants virus,PPRV）、绵羊肺腺瘤病病毒（Jaagsiekte sheep retrovirus,JSRV）、边界病病毒（Border disease virus,BDV）等,一旦感染,会引起大规模发病,给畜牧业的发展造成极大的经济损失。近年来,羊新发病毒性传染病引起了人们的广泛关注,发现与鉴定病毒新病原成为了预防、诊断及治疗新发病毒性传染病的首要任务。病毒宏基因组学是将环境、动物中的全部病毒作为研究对象,在病毒序列未知的情况下,系统揭示病毒组成,是一种新的病毒学研究手段,在探索新病毒中起到了重要作用。本研究通过病毒宏基因组学方法,对羊携带的病毒多样性进行了系统调查。通过对湖北487份羊OP液构建测序文库进行二代测序后,共发现了34个已知病毒科的病毒,其中感染哺乳类动物的病毒科有9个,在这些病毒科中,包含有非常重要的羊病毒病原:包括腺病毒（Adenovirus）、细小病毒（Parvovirus）、乳头瘤病毒（Papillomavirus）、多瘤病毒（Polyomavirus）、小RNA病毒（Picornavirus）、小双节RNA病毒（Picobirnavirus）等。我们针对高通量测序结果中病毒reads数最多的腺病毒进行了研究,通过设计特异性引物,完成了Ovine Adenovirus HNU4在羊中流行病学调查与基因组序列的鉴定,预测其编码29个基因,通过全基因组比对分析后发现,Ovine Adenovirus HNU4与Ovine adenovirus8具有较高的核苷酸序列同源性（90.675%）,进一步的遗传演化分析表明,二者的亲缘关系最为接近,同属于Ovine masteadenovirus C种。本研究结果揭示了羊食道-咽部分泌物的病毒组情况,完成了Ovine Adenovirus HNU4全基因组序列的确定、基因组注释和遗传演化分析,这也是首次在国内进行Ovine Adenovirus HNU4流行病学的研究,不仅丰富了数据库,也为更深入研究该病毒的传播机制以及可能对畜牧业或者人类造成的潜在危害创造了一个良好的开端。
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