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研究目的通过对我国部分地区普通女性常见阴道微生态失调、高危型别人乳头瘤病毒（High-risk Human Papillomavirus,HR-HPV）感染及阴道菌群构成情况的调查,探究自然人群中细菌性阴道病（Bacterial Vaginosis,BV）、外阴阴道假丝酵母菌病（Vulvovaginal Candidiasis,VVC）、滴虫性阴道炎（Trichomonal Vaginitis,TV）、HPV感染及人口学因素与宫颈细胞学病变及子宫颈上皮内瘤样病变（Cervical Intraepithelial Neoplasia,CIN）的相关性,并探寻BV、HPV感染（包括多重感染和不同HPV型别感染）和CIN与阴道微生物菌群的关系。材料和方法于2018-2019年在山西省武乡县和四川省盐亭县招募参加宫颈癌筛查的女性。收集其人口学信息、阴道分泌物标本及宫颈脱落细胞标本,采用实时定量聚合酶链反应（Polymerase Chain Reaction,PCR）技术检测 BV、VVC 和 TV,采用 PCR 扩增和DNA反向斑点杂交法相结合的DNA微流控芯片技术确定HPV基因型,采用16S rRNA基因测序检测菌群。采用多因素Logistic模型分析宫颈细胞学异常影响因素;利用QIIME2和R进行16S rRNA基因序列数据分析,描述并比较不同组间菌群多样性和相对丰度差异。研究结果1.共有645名来自四川省盐亭县女性纳入第一部分分析,包括408例未见上皮内病变或恶性肿瘤（Negative for Intraepithelial Lesion or Malignancy,NILM）、182例意义不明确的非典型鳞状上皮细胞（Atypical Squamous Cells of Undetermined Significance,ASC-US）、23 例低级别鳞状上皮内病变（Low-grade Squamous Intraepithelial Lesion,LSIL）和 32 例高级别鳞状上皮内病变（High-grade Squamous Intraepithelial Lesion,HSIL）女性。HR-HPV 阳性率（14.7%,39.0%,78.3%和87.5%）随细胞学严重程度增加呈现增加趋势（Ptrend<0.001）;BV的阳性率（34.1%,49.5%,60.9%和 43.8%）有显著差异（Ptrend=0.001）,ASC-US 和LSIL女性的BV阳性率显著高于NILM女性（P=0.003;P=0.05）;VVC在不同细胞学诊断的阳性率（14.2%,4.9%,8.7%和3.1%）差异显著（P=0.004）,ASC-US组显著低于 NILM 组（P=0.0.04）。TV 阳性率（2.5%,9.3%,4.3%和 6.3%）分布同样有显著差异（P=0.003）,ASC-US、LSIL组显著高于NILM组（P=0.002;P=0.038）。有序Logistic分析显示,HR-HPV感染、BV、TV、VVC、受教育程度低、已绝经与宫颈细胞学异常有关。教育程度为高中以下、已绝经,以及BV、TV和HPV感染宫颈细胞学异常的独立危险因素;VVC是宫颈细胞学异常的保护因素（P<0.05）。2.随着病理级别的升高,HPV阳性率呈现显著增加的趋势（Ptrend<0.001）。但各组间BV、VVC和TV阳性率无显著差异（P>0.05）。3.山西省武乡县和四川省盐亭县共1015名女性纳入第二部分分析,结果显示,HPV阳性和阴性组间的阴道菌群构成有显著不同。HPV 阳性组alpha多样性和beta多样性显著高于HPV阴性组。共有27个属的相对丰度在HPV阳性和阴性组间存在差异;随机森林模型分析显示,当纳入上述27个差异菌属时,获得的AUC值为0.652。平均基尼指数减少说明,Lactobacillus是本模型中影响力最大的预测因子,其次分别为Gardnerella和Prevotella。4.从non-BV&HPV-组（414例未患BV且HPV阴性女性）到non-BV&HPV+组（108例未患BV且HPV 阳性女性）,到BV&HPV-组（330例患BV且HPV阴性女性）,然后再到BV&HPV+组（163例患BV且的HPV阳性女性）,微生物多样性增加。13个菌属的相对丰度与HPV感染和BV相关,Gardnerella,Prevotella和Sneathia等菌属相对丰度显著上升,而Lactobacillus的相对丰度则明显下降。5.多重HPV感染,某些HPV基因型感染（如HPV16、HPV18）和CIN1与微生物多样性增加和一些HPV&BV相关的微生物的高相对丰度有关。6.与HPV持续阴性女性相比,新发HPV感染女性的菌群多样性更高,菌群构成存在差异。研究结论1.除HPV感染外,BV、TV、VVC均是细胞学异常的影响因素,但是主要与ASC-US及LSIL有关。此外,受教育程度低和已绝经也可能增加宫颈细胞学异常可能性。2.阴道菌群与BV,HPV感染（包括多种HPV感染和某些特定的HPV基因型）以及宫颈上皮病变均有关联。BV,HPV感染,多重HPV感染以及CIN2+增加了宫颈菌群多样性。3.Lactobacillus 是 HPV 感染、宫颈病变的保护因素;Prevotella,Gardnerella与 BV和HPV感染密切相关,并且对于预测HPV感染有重要意义。而某些菌群与HPV感染之间的关联因BV而存在争议。4.HPV是低度病变和高度病变主要的影响因素;BV相关的阴道微生物群均与宫颈低度病变有关,但与高度宫颈病变之间的关系尚未明确。