生态环境问题严重制约了经济社会的可持续发展。党的十九届四中全会中提出,生态文明建设是我国发展的千年大计,强调了生态审计对国家治理的重要性。生态绩效审计作为生态审计中的一个关键部分,其监督着生态文明建设的进程,不仅能够评价企业对资源的利用及回收情况,也有助于规范企业资源运用及环境管理。目前我国对生态绩效审计的研究尚不完善,研究大多是对概念的阐述,针对物流行业的评价指标体系实践应用也有所欠缺。因此,本文以平衡计分卡作为框架,结合国际标准与企业年报等给出的各类指标,构建出一套适用于物流业的评价指标体系,并对SF企业案例进行应用,找到该企业所面临的环境管理问题,并针对性的给出推广措施。具体内容如下:首先,本文在梳理国内外相关文献的基础上,阐述了生态绩效审计等相关概念与理论基础,论述了物流行业进行生态绩效审计的必要性与可行性。其次,基于理论基础,从财务维度、客户维度、内部流程维度、学习与发展维度四个方面构建了评价指标体系,根据设计原则与思路,从该四个维度选取共28个具体评价指标,从而形成一套符合物流行业的生态绩效评价指标体系。最后,结合建立的评价指标体系,运用层次分析法和专家打分法确定指标具体权重,选择SF公司作为案例对象进行生态绩效审计评价,并对评价结果展开进一步分析。本文研究发现:（1）生态绩效审计评价指标体系可以反映出物流行业的生态绩效现状,其可操作性和有效性得到了检验。（2）SF公司生态绩效审计存在诸多问题。具体表现在废物综合利用率低、员工素质差异大、节能设备投资不足、企业规章制度不够完善等问题。（3）生态绩效审计应用于物流行业还存在一定问题。如行业没有制定完整的评价标准以及良好的法律法规、生态审计人才的匮乏等。基于以上研究内容及结论,提出如下措施:从国家层面来看,应当完善生态保护及环境管理相关政策法规,强化社会责任信息披露等策略;对企业而言,应当做到“开源节流”、履行节能减排政策实现绿色物流、提高社会责任意识、加大内部审计对环境治理的监督以及抓好配合外部审计的审查工作等。