白鲟、达氏鲟线粒体DNA全序列及鲟形目分子进化研究

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本研究设计8对新的鲟形目(Acipenseriformes)鱼类线粒体DNA(mtDNA)特异引物,应用PCR技术扩增我国特有濒危鱼类白鲟(Psephurus gladius)和达氏鲟(Acipenser dabryanus)的整个mtDNA,并对PCR产物进行回收测序,得到白鲟和达氏鲟mtDNA全序列。结合有关鲟形目鱼类mtDNA数据,分析鲟形目鱼类mtDNA分子进化的特点。主要研究结果归纳如下: 1.引物扩增效果 8对引物均能特异扩增出白鲟和达氏鲟mtDNA片断,其中一个片断长约0.3kb,其余7个片断长2.0~3.0kb。所有扩增的片断覆盖整个mtDNA。 2.白鲟和达氏鲟mtDNA序列特征 白鲟和达氏鲟mtDNA全长分别为16483bp和16437bp,A、C、G、T含量分别为30.5%、30.0%、15.7%、23.8%和30.2%、29.7%、16.4%、23.7%,AT含量(54.3%和53.9%)大于GC含量,均包含13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因以及一个非编码的控制区(D-LOOP)。37个基因中,ND6和8个tRNA基因以L链为编码链,其余均以H链为编码链。除ND6基因外,12个蛋白质编码基因基因三联密码子第三位主要由A和C组成,G比重很低,而ND6基因密码子第三位G的比重接近5成;22个tRNA基因的大小为67—75bp,均可以折叠成典型的三叶草二级结构;在控制区序列可以找到三个保守序列区(Conserved sequence blocks,CSB),以及串联重复序列。白鲟和达氏鲟mtDNA全序列在GenBank的收录号分别是:NC005834和NC005451。 3.鲟形目鱼类mtDNA的分子进化 分别以13个蛋白质编码基因(去除起始密码子和终止密码子),13个蛋白
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