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本文利用4个微卫星标记(OarFCB11,OarAE101,McM218,McM38)对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了遗传检测,并测定了波尔山羊与河北奶山羊及太行山羊的实际杂交效果。结果表明:在OarFCB11标记共发现了10个等位基因,变异范围在141~185bp之间,其中等位基因153~157仅见于河北奶山羊中;在OarAE101标记共发现了9个等位基因,变异范围在109~129bp之间,其中等位基因119仅见于河北奶山羊中,等位基因121仅见于波尔山羊中;在McM218标记共发现了10个等位基因,变异范围在166~208bp之间,其中等位基因180和190仅见于太行山羊中,等位基因208仅见于河北奶山羊中;在McM38标记共发现了9个等位基因,变异范围在128~164bp之间,其中等位基因152仅见于河北奶山羊中,等位基因164仅见于波尔山羊中。标记OarFCB11的多态信息含量、有效等位基因数及群体杂合度最高,标记McM38最低,说明标记OarFCB11变异较大,标记McM38变异较小。 4个微卫星标记在波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊3个品种中存在多态性,可以用于山羊遗传多样性的评估;从不同品种来看,太行山羊的遗传变异程度最大,而波尔山羊的遗传变异程度相对较小;波尔山羊与河北奶山羊的遗传距离大于波尔山羊与太行山羊,说明波尔山羊与河北奶山羊的杂种优势高于波尔山羊与太行山羊。 实际杂种优势测定结果表明:波尔山羊与河北奶山羊杂一代羊初生重、4月龄重、8月龄重及8月龄屠宰率显著高于波尔山羊与太行山羊杂一代羊(P<0.05),波尔山羊与河北奶山羊的杂交效果显著高于太行山羊。 本研究通过实际测定波尔山羊与太行山羊及河北奶山羊的杂交效果与理论预测的杂种优势进行比较,得出同样的结果,说明用微卫星DNA多态性预测山羊品种间的杂种优势是可行的。利用微卫星DNA多态性预测山羊杂种优势即快速又节省成本,将对今后的山羊育种具有重要的应用价值。