一类计数型数量性状的区间定位

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在人类、动物及植物中,许多定量性状的改变都与遗传学效应有关.对定量性状位点(QTL)进行定位,也就是要在整个基因组中寻找影响数量性状位点的位置,具有一定的科学和经济价值.近些年,区间定位的方法被广泛应用到QTL的遗传定位中.最近,生物学中面临的一个最重要的挑战就是基于生物性状对环境因素的适应性来理解遗传机制,并且如何使用这些知识来预测对于环境的改变,生物体结构,组织以及功能的一系列反应.当一个生物体被种植在不同的环境中时,会产生一系列的表现型,生物体的这种对于环境变化而产生其表现型的改变的能力被叫做表现型的可塑性.它是一种由基因一环境相互作用下的遗传学的多样性.   本文中,我们利用区间定位的方法,考虑了一种计数型数量性状的QTL的参数估计问题.该QTL在不同的环境中受表现型可塑性的控制.由于表现型是计数型的,因此为了满足该性状的需要,我们应用了多元泊松分布来拟合性状,并使用EM算法来获得QTL位置和泊松参数的极大似然估计(MLE)的同步估计值,这样可以潜在的提高估计的功效.我们的模型也可以检验一些假设,这些假设用来解释表现型的可塑性,即在不同的环境中,QTL的一些不同的表现形式.模拟研究给出了该算法对于QTL位置和泊松参数估计的优越性,以及与现有方法的对比.同时,假设检验的模拟结果也表现出了我们的方法具有正确的第一类错误率和较高的功效.
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