【摘 要】
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兔的痒螨病是由绵羊痒螨(兔亚种)寄生于外耳道皮肤的表面,引起兔消瘦,耳内充满纸卷样痂皮为典型特征的一种慢性接触性皮肤传染病,给养兔业造成巨大的经济损失。线粒体基因因
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兔的痒螨病是由绵羊痒螨(兔亚种)寄生于外耳道皮肤的表面,引起兔消瘦,耳内充满纸卷样痂皮为典型特征的一种慢性接触性皮肤传染病,给养兔业造成巨大的经济损失。线粒体基因因进化速度快,遗传稳定性好等特点常被用做分子标记,可以进行物种的分子鉴定和种群遗传等研究。目前有关绵羊痒螨的线粒体基因种群遗传的研究较少。因此,本研究采用PCR技术扩增我国五个地区(华东、华中、华北、西北、西南)不同品种兔(獭兔和肉兔)痒螨虫株的线粒体12S、16S、ATP6基因全序列,并比较分析种群遗传变异情况,以揭示我国绵羊痒螨(兔亚种)虫株的遗传结构特征,评估痒螨种群对环境的适应能力。主要研究结果如下:1.基于线粒体12S和16S基因全序列对我国绵羊痒螨(兔亚种)种群遗传多样性的研究为了解我国痒螨种群的遗传多样性特点,本研究采用PCR技术对我国5个地区(华东、华中、华北、西北、西南)的绵羊痒螨(兔亚种)单个虫体的线粒体12S和16S基因全序列进行扩增、测序,并基于12S、16S和联合12S+16S基因序列分析痒螨种群的遗传多样性。共得到89条12S序列(657bp),83条16S序列(1025bp)和63条12S+16S序列(1682bp),分别存在50个(12S),52个(16S)和56个(12S+16S)单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为(12S:0.93105和0.00559;16S:0.95827和0.00686;12S+16S:0.99130和0.00633)表明我国绵羊痒螨(兔亚种)具有丰富的遗传多样性;分子方差分析(AMOVA)可见我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传变异主要发生在种群内部(12S:95.77%;16S:71.03%;12S+16S:76.31%);基于遗传分化指数(Fst值:12S=0.04232;16S=0.28972;12S+16S=0.23685)分析可见我国绵羊痒螨(兔亚种)各地理种群间存在一定的遗传分化但遗传分化不明显,种群间基因交流较为频繁(Nm值:12S=5.65737;16S=1.2258;12S+16S=0.80552);基于单个基因和联合基因的中性检验结果都为不显著的正值,结合错配分布曲线呈现多峰,暗示我国绵羊痒螨(兔亚种)种群在进化过程中没有发生过种群扩张;由单个基因和联合基因构建的单倍型网络图和NJ树可知,我国绵羊痒螨(兔亚种)种群未形成明显的遗传结构,绵羊痒螨(兔亚种)的聚类与地理来源、兔种类和温度带无关。2.基于线粒体ATP6基因全序列对我国绵羊痒螨(兔亚种)种群遗传多样性的研究为进一步了解我国兔体痒螨种群的遗传多样性,我们经PCR扩增测序得到我国5个地区绵羊痒螨(兔亚种)单个虫体的线粒体ATP6基因全序列,并进行遗传多样性分析。共得到88条ATP6基因全序列(672bp),包含41个单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为(0.92581和0.01494),可见我国绵羊痒螨(兔亚种)具有丰富的遗传多样性,这种遗传变异主要发生在绵羊痒螨(兔亚种)种群的内部(97.92%)(AMOVA分析);经遗传分化指数(Fst=0.02081)分析可见我国绵羊痒螨(兔亚种)各地理种群间存在一定的遗传分化,种群间基因交流较为频繁(Nm=11.7635);中性检验结果都为不显著的正值。结合错配分布曲线呈现多峰,暗示我国绵羊痒螨(兔亚种)种群在进化过程中没有发生过种群扩张;单倍型网络图和NJ树可知我国绵羊痒螨(兔亚种)种群并未形成以地理分布、兔品种、温度带划分的遗传结构。研究结果表明,我国绵羊痒螨(兔亚种)种群表现出较高的遗传多样性,种群间的基因交流较为频繁;我国绵羊痒螨(兔亚种)种群长时间内未发生过种群扩张事件,处于一个比较稳定的水平,未形成以地理分布、兔品种和温度带相关的遗传结构。
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