论文部分内容阅读
目的研究IL-12/IFN-y轴上五个基因的单核苷酸多态性与EV71感染手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)易感性的关系,这五个基因包括:白介素12B(IL-12B),白介素12受体β1(IL-12RB1),信号转导及转录激活因子4(STAT4),干扰素γ受体2(IFNGR2),信号转导及转录激活因子1(STAT1)。方法2014年3月至2015年6月,收集广西地区EV71感染HFMD患儿145例、EV71隐性感染儿童104例、健康对照儿童89例。采集非抗凝血提取血清,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定血清标本EV71 IgM、IgG及CoxA16 IgM、IgG抗体。采集抗凝血提取其外周血DNA,采用改进的多重高温连接酶检测反应技术(imLDRTM)检测三组人群IL-12/IFN-γ轴上27个单核苷酸多态性位点:IL-12B基因一个位点:rs2288831;IL-12RB1基因11个位点:rs12461312,rs17882555,rs1870063,rs2305740,rs2305741, rs17878265,rs3746190,rs375947,rs383483,rs391410,rs401502;STAT4基因七个位点:rs11676659,rs1517351,rs3024866,rs3024891, rs3024900, rs3024903,rs7574865;IFNGR2基因一个位点:rs9808753;STAT1基因七个位点:rs117037705,rs2066804, rs2280235,rs397897569,rs45515791,rs7597768,rs77910835的单核苷酸多态性,统计各个位点的基因型及等位基因频率,并分析各个位点基因型及等位基因分布与EV71感染HFMD易感性之间的关系。结果(1)EV71感染HFMD组与对照组比较,IL-12RB1基因六个位点(rsl2461312, rs17882555,1870063, rs2305740, rs2305741, rs3746190)的基因型及等位基因频率分布差异均有统计学意义(P<0.05),IL-12RB1基因rs12461312等位基因C、rs17882555等位基因G、rs1870063等位基因C、rs2305740等位基因A、rs2305741等位基因G、rs3746190等位基因G频率显著高于对照组;EV71隐性感染组与正常对照组比较,IL-12RB1基因的这六个多态性位点的基因型频率及等位基因频率分布差异均无统计学意义(P>0.05);EV71感染HFMD组和EV71隐性感染组比较,这些多态性位点基因型及等位基因均无统计学意义(P>0.05)。(2)EV71感染HFMD组和正常对照组比较,STAT4基因位点rs11676659的基因型差异具有统计学意义(P<0.05),EV71感染HFMD组基因型AA频率低于对照组,而STAT4基因rs11676659等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)EV71隐性感染组与对照组比较,rs11676659多态性位点的基因型频率及等位基因频率分布差异均无统计学意义(P>0.05)EV71感染HFMD组和EV71隐性感染组比较,STAT4位点rs11676659基因型差异具有统计学意义(P=0.049),EV71感染HFMD组基因型AA频率低于隐性感染组,其等位基因频率分布无统计学意义(P>0.05)。(3)EV71感染HFMD组和EV71隐性感染组分别与对照组比较,IFNGR2基因位点rs9808753的基因型及等位基因频率差异均具有统计学意义(P<0.05),EV71感染HFMD组和EV71隐性感染组基因型AA及A等位基因频率均显著高于对照组;EV71感染HFMD组和EV71隐性感染组比较,该多态性位点的基因型及等位基因均无统计学意义(P>0.05)。(4) IL-12RB1基因rs3746190(A/G), rs12461312(A/C), rs17882555(A/G), rs1870063(C/T), rs2305740(A/G),rs2305741(A/G)六个多态性位点经过连锁不平衡检测示:这六个多态性位点具有较强的连锁不平衡(D’>0.8并且r2>0.8),处于同一个连锁框内,可进行单倍型分析。EV71感染HFMD组和对照组比较,IL-12RB 1基因这六个SNP位点单倍型AAATGA在EV71感染HFMD组中低于对照组,差异具有统计学意义[P=0.0044<0.05, OR (95%CI):0.397 (0.207-0.762)],单倍型GCGCAG在EV71感染HFMD组显著高于对照组,差异具有统计学意义[P=0.017,OR(95%CI):2.116(1.131-3.956)]。(5)EV71感染HFMD组和对照组比较,IL-12RB1基因位点rs375947, rs383483, rs391410, rs401502的等位基因频率分布均具有统计学意义(P<0.05),在EV71感染HFMD组中位点rs375947等位基因A、位点rs383483等位基因A、位点rs391410等位基因G、位点rs401502等位基因C频率均高于对照组,这四个位点基因型分布差异均无统计学意义(P>0.05); EV71隐性感染组和对照组比较,及EV71感染HFMD组和EV71隐性感染组比较,这四个位点基因型及等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);EV71感染HFMD组、EV71隐性感染组分别和正常对照组比较,及EV71感染HFMD组和EV71隐性感染组比较,其余单核苷酸多态性位点基因型及等位基因的频率分布差异均无统计学意义(P>0.05)。结论(1)ⅠL-12RB1基因六个位点(rsl2461312, rsl7882555,1870063,rs2305740,rs2305741,rs3746190)的多态性可能与EV71感染HFMD易感性有关,与这些位点相对应的基因型及等位基因CC/C、GG/G、CC/C、 AA/A、GG/G、GG/G均是EV71感染HFMD的危险因素;(2)STAT4基因位点rs11676659的多态性可能与EV71感染HFN D易感性有关,基因型AG+GG及等位基因G是EV71感染HFMD的危险因素;(3)IFNGR2基因位点rs9808753的基因多态性与EV71感染易感性有关,基因型AA及等位基因A是EV71感染的危险因素;(4)IL-12RB1基因位点rs3746190,rs12461312, rs17882555, rs1870063, rs2305740, rs2305741单倍型GCGCAG是EV71感染HFMD危险因素,携带单体型GCGCAG的儿童患EV71感染HFMD的风险更高;(5)IL-12RB1基因四个位点rs375947、rs383483、rs391410、rs401502的等位基因可能与EV71感染HFMD易感性有关;IL-12B基因位点s2288831, STAT4基因五个位点rs3024866、rs3024891、rs3024900、rs3024903、rs7574865, STAT1基因七个位点rs117037705、 rs2066804、rs2280235、rs397897569、rs45515791、rs7597768、rs77910835的单核苷酸多态性与EV71感染易感性无关。