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我国的生物医药行业发展非常迅速，有巨大的潜在市场以及广阔的发展未来和前景。国家政策也对生物医药行业进行了大力的支持，出现了越来越多的生物医药行业的投资项目。不过到目前为止，生物医药行业投资项目的经济评价尚未有一个完全统一的标准，这使得很多潜在的投资者在投资前不能够客观地对项目进行经济评价，而仅仅是依靠国家公布的行业基准收益率或者自己的投资经验来做出决策。合理确定基准收益率是非常重要和基础的工作，它作为资金时间价值度量的同时，也是一个投资项目时衡量投资收益率的标准，对投资决策来说是不可或缺的。鉴于国家2006年公布的行业基准收益率取值表近年来没有做出调整并且并没有对生物医药行业进行测算，因此对生物医药行业基准收益率的研究有着重要意义。文章在厘清了基准收益率的概念和内涵后选取了两个角度研究生物医药行业的基准收益率，分别采用了WACC以及基于企业资本增长的基准收益率模型来测算生物医药行业的基准收益率。在WACC模型中，文章构建了生物医药行业资本结构最优化模型，利用基于产业和市场结合的CAPM模型计算权益收益率。结合资本结构优化值、权益资本成本以及债务资本成本计算出生物医药行业的基准收益率。基于企业资本增长的基准收益率模型考虑企业自身的投资偏好以及资本增长情况，是对以市场风险为基础的基准收益率测量模型的改进。WACC模型和基于企业资本增长模型的测算结果分别为13.65%和14.79。文章认为14.79%更加接近生物医药行业基准收益率的实际情况。文章分别从公司角度和项目角度研究生物医药行业基准收益率的分布，研究结果表明生物医药行业上市公司的基准收益率有规律地分布于某一水平，存在着一个行业的基准收益率水平。根据项目角度的基准收益率分布情况通过实证研究证实了制定基准收益率能够减轻上市公司的代理成本。