米象磷化氢抗性相关基因的表达分析

来源 :合肥工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bisha1007
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
米象是一种重要的贮藏害虫,对世界粮食产量产生威胁,由于熏蒸剂磷化铝的使用,米象产生了一定的PH3抗性。本文通过转录组技术,分析了米象几种代谢解毒相关基因谷胱甘肽硫转移酶,细胞色素P450和酯酶的表达;获得了米象基因遗传信息。目前,随着生物技术的进步,尤其是基因组学的广泛应用,可以在转录组水平研究米象基因的表达情况,进而从本质上全面揭示米象的磷化氢抗性。采用Illumina测序技术,米象敏感品系转录组测序共获得reads是22,128,957和6,562,957,738个核苷酸,PH3熏蒸品系转录组测序共获得reads是27,306,829和8,093,178,954个核苷酸。将转录组数据通过组装,将这些transcripts拼接成为42,173个unigenes。将得到Unigene提交蛋白质数据库(Nr)进行比对,共有16,610个返回有效结果。同时还将Unigene提交至其它数据库进行注释,共有17,335个Unigene得到成功注释。44.45%的Unigene与中欧山松大小蠹的相关基因同源性最高。26.96%的Unigene与赤拟谷盗的相关基因具有同源性。通过筛选,从米象转录组数据中共鉴定出323个与解毒代谢抗性相关的Unigene。主要编码包括谷胱甘肽硫转移酶28个、酯酶58个、细胞色素P450基因68个。克隆并测定了米象13个编码GSTs基因的cDNA全长序列,其中Epsilon家族6个、Sigma家族4个、Theta家族2个和Delta家族1个。米象GSTs基因中共鉴定出6个Epsilon家族的基因。获得米象P450基因11个。将其中的3个基因归类于CYP4家族,6个基因归类于CYP3家族,另归类于CYP mito家族2个。获得米象EST基因6个,分属3个不同的家族。米象敏感品系和磷化氢熏蒸后的品系差异表达基因中,米象磷化氢熏蒸后基因上调315个,下调535个。对识别到的差异表达基因进行功能注释。将得到的差异表达Unigene提交NCBI蛋白质数据库,共有687个返回有效结果。这些差异表达基因中的Unigene在GO分类中被划分到“biological process”、“cellular component”和“molecular function”的61个功能组中。COG分类注释了221个差异表达基因Unigene。同时对差异表达基因结果按照KEGG中通路类型进行分类。米象敏感品系经磷化氢不同浓度熏蒸和不同时间熏蒸处理。两个基因经LC30浓度的显著高于其它两个浓度;四个GSTs基因经LC50浓度的磷化氢熏蒸的相对表达量显著高于对照组和LC30、LC10处理组;三个基因相对表达量均显著低于对照组。7个GSTs基因随着熏蒸时间的增加,相对表达量逐渐升高。米象GSTs基因在不同发育阶段的相对表达模式中,SoGSTd1基因在四龄幼虫阶段的相对表达量最高;SoGSTe1基因在成虫阶段的相对表达量最高;SoGSTe2和SoGSTe5基因在四龄幼虫阶段的相对表达量最大,SoGSTe6基因的相对表达量在三龄幼虫阶段最大。米象13个GSTs基因在不同组织部位的相对表达模式中。米象13个GSTs基因中的11个在中肠、脂肪体或马氏管中的相对表达量均显著高于头部和表皮中的表达量。在EST基因中,随着磷化氢熏蒸浓度的增加,SoEST1基因的相对表达量也增加,SoEST2和SoEST5基因经磷化氢LC30熏蒸的相对表达量显著高于对照组。6个EST基因在不同发育阶段分析中。SoEST1在成虫和蛹期的相对表达量均显著较高;SoEST3基因在成虫阶段的相对表达量最高。在不同组织中,SoEST1基因在马氏管中的相对表达量最高;SoEST3基因在中肠中的相对表达量最高;SoEST5基因在脂肪体中的相对表达量最高;SoEST6基因在中肠中的相对表达量最高。在米象P450基因中,经LC30浓度的磷化氢熏蒸24h后,基因的相对表达量显著高于对照。米象7个P450基因的相对表达量随着磷化氢熏蒸时间的增加而逐渐增大。在不同发育阶段,5个P450基因在成虫和四龄幼虫阶段的相对表达量均显著偏高;4个基因在成虫阶段的最高。在不同组织部位中,4个P450基因在中肠的相对表达量最高,3个基因在马氏管中的最高。
其他文献
2010年11月16日,柬埔寨王国斯登沃代一、二级水电站工程一期截流阶段验收会议在二级坝业主临时营地召开。会议由柬埔寨斯拿沃代一、二级水电站工程一期截流阶段验收委员会委员
P2P下载与网络蠕虫具有相似的搜索机制,导致网络蠕虫难以被检测并定位。该文提出一种融合危险理论和ID3分类算法的检测算法D—ID3。利用熵理论分析P2P应用、蠕虫、正常主机的
目的探讨儿童暴发性心肌炎的临床特点及诊治方法。方法对14例儿童暴发性心肌炎患者的临床表现、辅助检查结果、诊治情况及转归结局进行回顾性分析。结果 14例患儿经治疗后治
目前我国对天然气的需求量在逐年增加,而天然气作为不可再生能源的一种,随着开采量的加大将不可避免的有面临枯竭的一天,因此寻求一种清洁、可再生的替代能源势在必行。沼气
“富煤、少油、有气”是我国当前总的能源储量结构特点。煤基替代燃料的使用能够有效的缓解我国的能源短缺及不平衡问题,有利于国家转变能源发展方向和提高能源效率,对于缓解
周恩来是我国伟大的无产阶级政治家、革命家和思想家,是新中国的重要缔造者之一。周恩来为中国革命事业的胜利作出了巨大贡献,但是他对马克思主义的接受和实践却不是一蹴而就,他的世界观并不是以对马克思主义的信仰为开始,他对马克思主义的接受和实践经历了一个曲折、复杂的过程。周恩来是在逐步接触、学习马克思主义的相关理论与实践之后,信仰开始转变,主要经历了朴素的爱国主义者、民主主义者和坚定的马克思主义者三个阶段最
自2016年以来,区块链技术在我国迅速发展,各个领域积极寻求着对区块链技术的应用,区块链技术从比特币的1.0阶段发展到以太坊的2.0阶段,时至现在,区块链技术已经发展至社会各
研究片上网络流量产生与接收模型,提出支持多种流量模型的IP核体系结构。提供微处理器接口,通过配置寄存器参数产生特定流量的数据包,并使用读寄存器得到吞吐量、延时和误码等网
加入WTO后,我国与国际间的经贸往来越来越频繁,国际经贸准则和法律规范与我国有很多不同.我国的<合同法>也逐渐修订,以期与国际进一步接轨,促进经贸的发展,其中<合同法>中有
合理薪酬标准的设计,涉及企业的人才、资金、信息、物资要素的定位、配置和有效流动,影响企业的劳动效率和经济效益.企业管理的不断进步,管理重心从物到人,突出"人本管理",是