基于高通量测序对外泌体调节卵巢癌细胞株A2780顺铂耐药性相关miRNA的筛选、鉴定及功能研究

来源 :福建中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:new4sophia
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探讨卵巢癌顺铂耐药细胞株A2780/DDP细胞上清来源的外泌体对其亲本细胞株A2780的影响,筛选并鉴定A2780/DDP和A2780细胞上清液中外泌体mi RNA的差异,寻找与卵巢癌顺铂耐药相关外泌体mi RNA靶点,同时在卵巢恶性肿瘤中初步探索外泌体mi RNA的相关功能及作用。方法:1.超速离心法或试剂盒法获得A2780/DDP细胞上清来源外泌体;透射电子显微镜直接观察细胞上清提取物的形态和大小;纳米粒径分析仪检测细胞上清提取物的粒径大小;Western Blot检测细胞上清提取物表面标记蛋白指标CD63、CD9、Ep CAM及Annexin V的表达情况。2.将提取的A2780/DDP细胞上清来源外泌体与A2780细胞株共培养后,Western Blot检测p62、LC3-I及LC3-II等自噬相关蛋白在处理后的A2780细胞株中的表达水平;CCK8法检测处理后的A2780细胞存活率;免疫荧光显微镜观察Dil染色后的A2780/DDP细胞上清来源外泌体在Dio染色后的A2780细胞株中的摄取情况。3.提取A2780及A2780/DDP细胞上清来源外泌体,差异性外泌体mi RNA表达谱使用高通量测序(HTS)技术检测;相关外泌体mi RNA的靶基因使用mi RDB及Targetscan在线数据库预测;外泌体mi RNA相关功能及通路分别利用GO及KEGG数据库预测。4.RT-q PCR验证3个在A2780/DDP中上调的外泌体mi RNA表达情况;外泌体mi RNA的关键靶基因通过PPI网络预测;卵巢癌hsa-mi R-675-3p和IC50的相关性通过GDSC数据库联合TCGA数据库预测;从UCSC-Xena平台提取卵巢癌样本,联合GENCODE数据库构建mi RNA-m RNA网络;R语言联合ESTIMATE、GSVA、CIBERSORT、MCPcounter及x Cell等5种算法预测hsa-mi R-675-3p与卵巢癌免疫微环境的相关性。结果:1.透射电子显微镜结果显示A2780/DDP细胞上清提取物呈囊泡状,且直径在40-120nm;纳米粒径仪检测结果显示细胞上清提取物的直径在40-120nm;Western blot结果显示细胞上清提取物蛋白指标CD63、CD9、Ep CAM、Annexin V的表达均有明显增强的趋势。2.A2780/DDP细胞上清来源外泌体与A2780细胞株共培养48h后:Western Blot显示与A2780对照组(未添加外泌体共培养)相比,A2780实验组(添加外泌体共培养)P62、LC3-I及LC3-II等自噬相关蛋白的表达水平均有增加趋势;CCK8结果显示A2780实验组48h的顺铂IC50有一定变化;免疫荧光实验结果显示A2780细胞株可摄取A2780/DDP细胞上清来源的外泌体。3.HTS结果显示:A2780及A2780/DDP细胞上清来源的外泌体中,103个mi RNA表达上调,23个mi RNA表达下调(DE-mi RNAs的识别阈值存在两倍及以上的变化,P<0.05)。筛选10个在卵巢癌顺铂敏感细胞株A2780/DDP细胞上清中上调的外泌体mi RNA,利用在线数据库mi RDB及Targetscan预测下游靶基因,外泌体hsa-mi R-675-3p下游靶基因可使用Venny图归类。GO分析结果显示:生物过程(BP)包括细胞过程、发育过程及解剖结构发育等方面;细胞组成(CC)包括细胞过程、发育过程及解剖结构发育的调控等方面;分子功能(MF)体现在蛋白质结合、转录活性及DNA结合等方面。KEGG分析结果显示:PI3K-Akt信号通路、Wnt信号通路、Erbb信号通路等可能参与了卵巢癌耐药的过程。4.RT-q PCR显示:在卵巢癌顺铂耐药细胞株A2780/DDP来源的外泌体中,hsa-mi R-675-3p表达水平最高,其次是hsa-mi R-429和hsa-mi R-371a-5p。PPI分析结果显示:FMR1和CD86是关键的靶基因。抗癌药物敏感数据库GDSC分析结果显示:hsa-mi R-675-3p和hsa-mi R-429的实时免疫荧光表达量与相关卵巢癌组织的顺铂IC50之间呈正相关性。Mi RNA-m RNA调控网络分析结果显示:耐药相关蛋白ANXA1、AREG、DUSP1、DUSP、EGR1、HRAS、IL6、ILK、MAFB、MFAP5、MSLN、NR4A1、PINK1、PRKCDBP、PTGER3、SNCA、STIM1及TGFBI与hsa-mi R-675-3p呈一定相关性(P<0.05)。R语言分析免疫相关微环境结果显示:hsa-mi R-675-3p在卵巢癌基质细胞、免疫细胞浸润和肿瘤纯度之间相关性均存在统计学差异,hsa-mi R-675-3p高表达与血浆树突细胞、CD56阳性自然杀伤细胞及中央记忆CD8 T细胞高表达相关;高表达的单核细胞、髓系树突状细胞、卵巢癌上皮细胞与高表达的hsa-mi R-675-3p相关(P<0.05)。结论:1.本研究提示人卵巢癌细胞株A2780/DDP和A2780细胞上清来源提取物中可成功分离到外泌体。2.卵巢癌顺铂耐药细胞株A2780/DDP细胞上清来源的外泌体可被卵巢癌细胞株A2780细胞摄取,并影响其顺铂耐药与细胞自噬水平。3.A2780/DDP细胞上清来源的外泌体hsa-mi R-675-3p可能是卵巢癌顺铂耐药的潜在靶点。
其他文献
在小学英语教学中,阅读对于帮助学生学习语法和积累词汇、提升学生英语知识的运用能力、培育学生的英语核心素养具有重要作用。教师应结合阅读教学现状,对课内外阅读教学进行创新、整合和调整,以课内文本为切入点、以课内阅读主题为切入点、以文章中的难点为切入点、以课内文本体裁为切入点多方面开展拓展阅读,通过课内阅读带动课外阅读,从而有效提升小学英语阅读教学质量。
舞台服装设计是舞台艺术表演活动中的重要环节,依托设计师设计的舞台服装,可增加舞台艺术的表现色彩,提高舞台艺术效果。舞台服装具有艺术美学属性,它源于生活服装,又高于生活服装,在舞台服装设计中合理运用民族风格元素,既能迎合人们日益变化的审美情趣,又能满足人们日益提升的精神文化需求。因此,以民族风格元素为研究对象,分析其在舞台服装设计中的应用,更有利于舞台服装设计师转变设计理念,升华设计思想,开辟舞台服
舞台服装设计是舞台美术创作中的一个重要组成部分,也是对舞台上人物的一种包装。由于舞台服装设计是由实际的舞台演出特性决定的,因此,其在各个方面的要求都相对比较高,尤其是在色彩、款式、面料、工艺等方面,都需要融入一定的美学艺术。因此,针对舞台服装的设计来说,需要其从美学艺术角度进行分析,保证设计的合理性和美学性,以此保证能够在表达出整个舞台演出人物形象同时,为观众提供美好的观看感受。
<正>要想提高学生的英语成绩,就必须通过各种方法使学生的阅读能力得到拓展,同时也使学生的思维能力得到更好的发展。教师在进行小学英语教学时,应该充分利用课堂的45分钟时间组织学生开展多种多样的英语拓展阅读,从而帮助学生对之前学过的内容进行巩固,之后教师还可以把一些课外读物推荐给学生,从而使学生的英语阅读量得到开拓。
期刊
阅读教学在培养学生英语学科核心素养方面具有重要作用。然而由于课外阅读材料不足、教学模式单一等因素,导致学生的英语阅读无法真正发生。教师应从深度学习的角度出发,精心组织拓展阅读材料,开阔阅读视野;采用合作拼图式阅读,丰厚阅读体验;通过阅读发布,促进深度思维,实现学科育人价值,从而促进学生开展深度阅读,培养学生的阅读素养。
阅读作为英语教学中的重要组成部分,是教学中不可忽视的重要内容。教师更加需要通过拓展阅读教学的开展让学生的英语知识得以巩固,让学生的阅读能力得到提升。坚持"以学习为中心"的英语拓展阅读教学的延伸,学生将能够学习到更多的知识,将能够更好实现英语教学质量的提升。
进入初中,随着学习科目的增多和学习难度的增大,两极分化现象逐渐凸显,为更好的解决这个问题,合作学习的课堂教学更能激发学生学习英语知识的主动性和积极性,更能强化学生的学科素养。作为一种新型的教学方式,合作学习能为学生提供一个更加自由、更加轻松的学习氛围,让他们的互动变得更加紧密,让学生在讨论中学会倾听、表达与交流。如何有效地组织学生开展小组合作学习正成为目前师生普遍关注的热点问题。本文通过阐述合作学
将符号学的概念引入舞台服装具有双向含义。符号学探讨的内容包括能指和所指产生意指关系的过程,然而舞台服装的设计、演出过程恰恰体现的就是"能指"和"所指"产生意指关系的过程,并且舞台服装的"意指"作用又具有自身的特殊性,这就更加体现出符号学在舞台服装上的意义了。本文以程钧服装设计为例,探析了舞台服装的符号意义。
在舞台表演进程中服装是舞台造型重要元素,与舞台效果、表演主题相契合,相较于普通服装设计,舞台服装设计具有针对性、特殊性、丰富性,在保障其实用性基础上,更加关注舞台服装设计艺术性,通过色彩、造型、款式、面料工艺等方面的设计,使舞台服装设计更具美学价值。本文通过探析舞台服装设计的美学艺术,以期提高舞台服装设计质量。
文言文教学,一直是语文教学的重难点,传统教法多是先言后文、言文叠加、重言轻文,教学内容固化单一,形式重复单调,课堂沉闷单薄。文言文本是一个整体,所以"文"和"言"也应作为一个整体,通过教师的设计,将"言"和"文"回归一体、自然融合,这样,文意理解便水到渠成,情思志趣也一脉相承,即教学的"文言合一"。学习文言文,更重要的是学习先贤思想、古代文化,以及传承经典和民族瑰宝,同时,也是"以古鉴今""择善而