儿童过敏性紫癜基因表达谱及肾损伤相关基因研究

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目的:用Roche NimbleGen人基因表达谱芯片技术筛选过敏性紫癜(HenochSchonlein purpura,HSP)患儿疾病发生及肾损伤相关基因,以进一步从分子水平更全面、系统地分析儿童HSP发生发展及肾损伤发生机制。方法:利用Roche NimbleGen人基因表达谱芯片(约含有45033个基因),分别检测单纯过敏性紫癜组外周血(HSP)、紫癜性肾炎组外周血(HSPN)、健康对照组外周血(C)的基因表达谱,用相关生物信息学分析方法对不同实验组间基因表达谱进行差异分析,最后应用实时定量PCR技术对部分差异表达基因进行验证。结果:1、单纯过敏性紫癜组与对照组间:共有1064条差异表达基因,其中2倍以上差异基因225条,2.5倍以上38条,3倍以上5条;其中225条2倍以上差异基因中146条表达上调,79条表达下调。紫癜性肾炎组与单纯过敏性紫癜组:共有830条差异表达基因,其中2倍以上差异基因283条,2.5倍以上118条,3倍以上51条;其中283条2倍以上差异基因中180条表达上调,103条表达下调。2、随机选取其中3条差异基因进行Real.time PCR验证,其结果与基因芯片筛查结果一致,结果充分证实表达谱芯片差异表达基因结果的可靠性。3、对单纯过敏性紫癜组与对照组2倍以上差异基因进行GO生物学过程分析发现,已知功能分类的共119条,主要涉及:转录/翻译、物质合成/代谢过程和信号转导/通路相关基因,其次为分化/发育、免疫/炎症和凋亡/抗凋亡相关基因;而在紫癜性肾炎组与单纯过敏性紫癜组2倍以上差异基因中,我们发现已知功能分类的有201条,主要涉及:物质合成/代谢过程相关基因,其次为转录/翻译、免疫/炎症、信号转导/通路、分化/发育和细胞周期。4、初步筛选出免疫炎症/细胞黏附/信号转导通路相关基因AIF1、LAMC2、BCAM、CD209、MFAP4、ELMOD3、SCUBE1、ADAM33、RET、CLEC7A、MASP2、TAPS、AOAH、MGST2、PSMA3、SP100,代谢/凋亡相关基因MUC3B、MUC1、HSD11B1、MTHFS、TNFAIP8及未知基因BM88、CEACAM3等可能在HSP发病中起重要作用,同样也筛选出免疫炎症/信号转导通路相关基因KRT18、GRB10、VEGFB、HSP90AB1、HSPD1、F12、TGFBR2、TGM2、UBE2L6、CTSS、PXDN、GBP2、HLA-DRB1、HLA-DMA、HLA-DPA1,代谢/分化发育/凋亡相关基因SORD、HSPE1、ARG2、HSP90AA2、PRAME、TNFAIP2、MMP19、ZFP36L1,细胞黏附相关基因CLDN4及未知基因CKMT1B等可能与HSP肾脏损伤的发生密切相关。结论:1、首次用快速高通量的表达谱芯片筛选出过敏性紫癜及紫癜性肾炎相关基因。2、初步筛选出(AIF1、BCAM、CLEC7A、CD209、AOAH、MAPS2等)可能导致HSP发病的易感基因,进一步证实了免疫炎症、细胞黏附相关基因的表达异常可能在HSP发病过程中起到了主导作用,同时也发现了一些可能导致HSP发生的代谢/凋亡相关基因(如MUC3B、HSD11B1、MTHFS、TNFAIP8等)及未知基因。3、研究不仅证实了在HSP肾损伤过程中可能起重要作用的已被认识的基因如VEGFB、HLA-DRB1,也首次发现了一些以往在HSPN发病过程中未曾报道的已知基因(如SORD、ARG2、ZFP36L1、TGM2、KRT18等)以及未知基因。4、针对这些基因的深入研究,将有助于更全面、系统地揭示过敏性紫癜的分子机制。
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