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目的:从蛋白、基因水平研究时钟基因Per1、Per2、Per3在头颈部鳞癌及正常组织中的表达与临床特征、分期和生存之间的联系,望为临床评估患者疗效及预后提供参考依据。方法:收集头颈部鳞癌组织标本20例,头颈部正常组织标本7例,采用实时荧光定量PCR法检测Per1、Per2、Per3基因的表达水平,通过相对定量法分析Per1、Per2、Per3基因在头颈部鳞癌组织及头颈部正常组织中的表达是否有差异,及头颈部鳞癌组织中Per1、Per2、Per3基因表达水平与早期、晚期患者之间的关系。同时采用免疫组化法检测60例头颈部鳞癌标本及20例头颈部正常组织标本中Per1、Per2、Per3蛋白表达情况,运用染色程度分级与染色细胞百分比相乘结果测定Per1、Per2、Per3蛋白表达水平,分析头颈部鳞癌组织及头颈部正常组织中Per1、Per2、Per3蛋白之间的关系,并从蛋白水平分析其与患者临床特征、肿瘤临床分期、即刻疗效和生存之间的关系。结果:实时荧光定量PCR法检测显示Per1、Per2、Per3基因在头颈部鳞癌组织中及头颈部正常组织中均有表达,但头颈部鳞癌组织中Per1、Per2、Per3基因的表达较正常组织明显下降(P<0.01),晚期患者中Per1、Per2、Per3基因下调水平均高于早期患者,且Per2、Per3基因下调程度明显高于早期患者,差异有统计学意义(P<0.01)。运用免疫组化法检测表明头颈部鳞癌组织中Per1、Per2、Per3蛋白阳性表达率明显低于正常组织中的阳性表达率,差异有统计学意义(P<0.05),且头颈部鳞癌组织中Per1、Per2、Per3蛋白阳性表达与肿瘤临床分期有明显相关性(P<0.05),但其与患者年龄、性别无关。即刻疗效方面,Per1、Per2、Per3蛋白阳性组患者其治疗有效率高于阴性组患者,其结果具有统计学意义(P<0.05)。头颈部鳞癌患者中Per1、Per2、Per3蛋白阳性组患者的1、2、3年OS明显高于阴性组,差异有统计学意义(P<0.05);Per1、Per2、Per3蛋白阳性组患者的1、2、3年PFS、RFS均明显高于阴性组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:Per家族基因表达的降低可能与头颈部鳞癌的发生具有相关性,且在晚期患者中其Per2、Per3基因的下调程度高于早期头颈部鳞癌患者;Per家族蛋白表达阳性的头颈部鳞癌患者较阴性患者其可能具有更长的OS及PFS,RFS,而这也提示Per家族基因与头颈部鳞癌的预后中具有重要作用。