论文部分内容阅读
湖羊是我国著名的多胎品种,平均产羔率达256%,高繁殖率选育群可达300%以上。在实际生产过程中,如母羊多胎或母体体质弱、母乳不足、羔羊规模化育肥和工厂化生产、优良品种母羊一年两产等情况,需要羔羊早期或超早期断奶。先前的研究主要围绕羔羊早期断奶的方法和缓解断奶应激的技术措施展开。对于断奶过程中的分子调节机制的研究相对较少。本研究选用初生双胞胎湖羊作为研究对象,随母哺乳至3日龄,采用配对试验设计,对照组随母哺乳,试验组饲喂代乳品至15日龄屠宰,取羔羊空肠组织。对断母乳羔羊肠道组织进行切片分析,同时采用RNA-Seq技术和iTRAQ技术分别对断母乳湖羊羔羊肠道差异表达基因和差异表达蛋白进行分析。结果如下：1.组织形态学分析表明断母乳羔羊肠道组织形态发生明显变化,主要表现为肠绒毛长度缩短,隐窝深度增加。2.采用RNA-seq技术分析断母乳对羔羊肠道组织基因mRNA水平的影响。RNA-seq结果显示,肠道组织样品表达转录本注释得到的基因有24592个,对所有能够比对上基因组的基因按padj< 0.05的条件筛选,共有482个差异表达基因。其中,断母乳组表达上调的基因有235个,表达下调的基因有247个。差异表达基因GO和KEGG分析结果显示,差异表达基因主要参与调节机体营养素的代谢,消化系统、免疫系统和内分泌系统。通过RNA-seq数据分析,我们发现4个免疫相关的新基因,分别为ENSOARG00000010572, ENSOARG00000015002, ENSOARG00000009042和ENSOARG00000014493。3.采用iTRAQ技术对断母乳羔羊肠道组织进行蛋白质组学分析,共鉴定得到蛋白5338个,根据筛选标准FC>1.2或<0.83,且经统计检验其p-value<0.05的蛋白作为差异蛋白,断母乳组羔羊共得到差异蛋白389个,其中表达上调蛋白143个,表达下调蛋白246个。差异表达蛋白主要参与生物学过程包括免疫系统、物质代谢、生物黏附和细胞迁移等过程。本研究采用联合组学技术,从mRNA水平和蛋白质水平探讨断母乳羔羊肠道基因表达模式和代谢通路,为后续羔羊揭示羔羊断奶应激的分子调控机制提供依据。