为了掌握湖南南山国家公园的鸟兽资源现状，并为保护不同生境类型中的鸟类和兽类、可持续利用公园内的野生动物资源提供依据。2018年3月至2019年5月，利用样线法和红外相机陷阱法结合，通过布设总长度248km的样线、红外相机66台，对湖南南山国家公园整体进行鸟类和兽类的群落结构及多样性调查，分别对具有代表性的4种栖息地类型下的鸟类群落进行分析和比较。主要调查结果如下：
　　(1)共调查到鸟类135种，隶属于14目44科；雀形目占比最大，有92种；留鸟有87种，冬夏候鸟共40种，旅鸟5种。区系组成以华南区、华中区占比最高。调查到国家一级、二级重点保护鸟类共18种；“三有”保护鸟类84种；中国特有鸟类5种；濒危野生动植物种国际贸易公约I鸟类1种，公约II鸟类13种；中国脊椎动物红色名录易危(VU)鸟类3种，近危(NT)鸟类9种。共调查到兽类12种，隶属于3目6科。食肉目占比最大，有6种，啮齿目与偶蹄目各有4种。红腿长吻松鼠的分布最广，相对丰富度最大，其次为野猪。区系组成以华南区、华中区占比最高。调查到国家二级重点保护兽类1种；“三有”保护兽类11种；濒危野生动植物种国际贸易公约I兽类1种，公约II兽类1种；中国脊椎动物红色名录易危(VU)兽类4种，近危(NT)兽类4种。
　　(2)湖南南山国家公园内鸟类Shannon多样性指数为3.6498，Shannon均匀度指数为0.7547。与省内的洞庭湖地理单元、舜皇山国家级自然保护区，省外的江西老虎脑省级自然保护区、贵州阿哈湖国家湿地公园相比，除鸟类物种数仅次于洞庭湖地理单元外，多样性指数和均匀度指数都处于中等水平。从各项多样性指数分析，高山台地草原生境综合评价最优，针阔叶混交林生境其次，湿地生境再次，阔叶林生境评价较低，其中湿地生境与阔叶林生境多样性差异显著。从群落相似性分析，高山台地草原生境与湿地生境的相似度最低，湿地生境与阔叶林生境相似度最高，其余各生境间的相似度均居于其间。
　　(3)对3种常见兽类和1种常见雉科的全年和四季日节律进行调查，发现全年活动曲线均为双峰型，其中白鹇四季活动强度差异明显，秋季＞夏季＞春季＞冬季；红腿长吻松鼠秋季活动强度明显大于其他三季，其他三季活动强度差异不明显；野猪秋季活动强度最大，春季活动强度最小，夏季和冬季活动强度均处于其间且差异不明显；黄鼬日间(08: 00-18: 00)无活动记录，夏季活动强度最大，冬季活动强度最小，春季和秋季活动强度均处于其间且差异不明显。