广东某鸡场及其周边环境大肠杆菌耐药性和耐药基因流行特征

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在规模化养殖中,抗菌药物的大量使用促进了大肠杆菌耐药性的产生,给临床治疗带来巨大挑战。养殖场产生的耐药菌有可能排放到周边环境中,污染水体和农作物。本论文初步对广州某养鸡场及其周边环境中的大肠杆菌耐药性及耐药基因的分子流行病学进行初步研究,为养鸡场合理使用抗生素提供指导,并为探索大肠杆菌耐药性的传播途径提供理论依据。2016-2017年,在广州番禺某养鸡场采集440份不同年龄段鸡群粪便样品和108份鸡群饮用水样品,随机分离得到329株粪便源和36株鸡饮用水源大肠杆菌;在该鸡场附近的鱼塘和菜地采集35份鱼塘淤泥样品、27份鱼塘水样品、60份蔬菜样品以及17份菜地土壤样品,分离得到7株淤泥源、13株鱼塘水源、13株蔬菜源和7株土壤源大肠杆菌。另外,在远离该鸡场且与其无关的广州某农场里采集30份池塘水样品、22份土壤样品、5份淤泥样品以及15份蔬菜样品,分离得到12株池塘水源、11株土壤源、5株淤泥源以及2株蔬菜源大肠杆菌。采用琼脂稀释法对分离到的大肠杆菌进行药物敏感性试验。其中,鸡粪便源大肠杆菌对氨苄西林、链霉素、四环素和复方新诺明耐药率均达到90%以上,对头孢喹肟和头孢噻肟耐药率分别为65.05%和74.47%,对头孢西丁相对敏感;鸡饮用水源大肠杆菌与粪便源大肠杆菌的耐药情况基本相似,但对头孢类药物的耐药性更为严重。鸡场附近环境中大肠杆菌对各种药物的耐药率较鸡源大肠杆菌低,但明显高于远离鸡场的某农场中分离出的大肠杆菌。所有菌株均对亚胺培南敏感。采用PCR及测序方法分别检测分离株中耐药基因blaCT X-M-1G、blaCT X-M-9G、mcr-1、flo R、oqx AB、blaCMY-2、rmt B和fos A3的携带情况,结果检测到157株blaCT X-M-1G株阳性菌株,包括144株分离自鸡场的菌株和13株分离自鸡场附近环境的菌株,其中blaCT X-M-55型检出最多,共133株,其次为blaCT X-M-123(17株)、blaCTX-M-64(6株)及blaCT X-M-3(1株);检测到93株blaCT X-M-9G阳性菌株,鸡场样品中检出92株,鸡场附近环境中检出1株,其中blaCT X-M-14型44株,blaCT X-M-65型46株,blaCT X-M-27型3株。另外检测到46株mcr-1阳性菌株、317株flo R阳性菌株、21株oqx AB阳性菌株、2株blaCMY-2阳性菌株、40株rmt B阳性菌株和66株fos A3阳性菌株。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对blaCT X-M-55和blaCTX-M-123阳性大肠杆菌进行克隆传播关系的研究。随机挑选中64株blaCT X-M-55和17株blaCT X-M-123阳性大肠杆菌进行PFGE分析,结果有72株分型成功,9株分型失败。分型成功的58株blaCT X-M-55阳性菌可分为40不同PFGE型,14株blaCT X-M-123阳性大肠杆菌可分为8个不同的PFGE型。表明部分blaCT X-M-55和blaCTX-M-123阳性大肠杆菌在鸡场与其附近环境中存在克隆传播现象。本研究结果表明该鸡场大肠杆菌耐药情况非常严重,尤其对第三代头孢类药物的耐药率高达70%以上。blaCT X-M-55型基因是该鸡场及其周边环境源大肠杆菌中最为流行的超广谱β-内酰胺酶基因。同时,blaCT X-M、fos A3、flo R等耐药基因在该鸡场及其周边环境的传播应该引起鸡场管理上的高度重视,科学合理使用抗菌药物,以防止耐药菌的扩散传播。
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