近年来,塞内卡病毒 A（Seneca virus A,SVA 或 Seneca Valley virus,SVV）引起的猪水泡性疾病在不同地区和国家爆发,传播非常迅速,导致了巨大的经济损失。作为一种新型的引起猪水泡性疾病的病原,目前已经发现SVA病毒正在发生重组和进化,引起了养猪业的重视。中国作为养猪大国,自2015年以来,全国各地陆续报告了关于SVA的病例。本研究对收集自我国浙江、江苏、湖南等地区猪的粪便及水泡液样品进行SVA检测,并从阳性样品扩增SVA全基因组,进一步对获得的基因组序列进行系统发育分析,从而探讨其遗传演化规律。目前,缺乏针对塞内卡病毒A感染的有效治疗药物和疫苗,因此找到能够抑制SVA感染的药物及其重要。本研究通过体外抗病毒试验对目前已知的三种具有广谱抗病毒作用的药物进行抗SVA的效果研究,结果显示甘草酸二铵（Diammonium Glycyrrhizinate）、甘草酸二钾（Dipotassium Glycyrrhetate）和纳米银（Ag-NPs）均具有良好的体外抗SVA效果,并且甘草酸二铵和甘草酸二钾作为中草药提取物,细胞毒性小,少量用药就能达到较好的抗病毒效果,可以作为治疗SVA的备选药物。具体内容如下:1.SVA的流行病学调查及遗传进化分析本研究中我们从浙江、江苏、河南等五个省份的养猪场中收集了共113份粪便和水泡液病料,使用PCR方法进行SVA检测,结果显示其阳性率为6.2%,并从阳性病料中成功扩增出3条SVA全基因组序列,分别命名为CH-ZJ-3、CH-ZJ-4和CH-Henan-Y,均与2017年和2018年分离的中国毒株具有较高的核苷酸相似性。系统发育分析表明,这三个SVA毒株都属于Clade Ⅲ,与2017年和2018年发现的中国毒株聚集在一起,并且与美国毒株共属于一个大的分支,而2015和2016年的中国毒株与加拿大和巴西毒株聚集在一起。结果表明,这些SVA毒株不能简单地按国家进行聚类,而是可能来源于不同的国家,这也表明目前在中国流行的SVA毒株可能有不同的来源。同时,将测得的三条序列与CH-01-2015和SVV-001相比,已经发生较多氨基酸改变,这些突变可能与病毒进化和毒力增加有关,值得进一步研究和监测。2.三种药物的体外抗塞内卡病毒A作用试验本研究目的在于初步筛选出具有抗SVA效果的药物,为以后研发治疗SVA的药物奠定基础。首先通过qPCR测定病毒mRNA的表达量和测定病毒滴度这两种方法证明了甘草酸二铵和甘草酸二钾能够在ST细胞上抑制SVA子代病毒的繁殖,而纳米银具有直接灭活SVA病毒粒子的作用,而且三种药物对SVA的抗病毒作用在安全浓度范围内与剂量呈正相关,随着药物用量的升高,抗病毒作用越显著,并且对不同剂量的病毒都具有明显的抗病毒作用。同时,当病毒感染细胞后,甘草酸二铵和甘草酸二钾加入的时间越早,对病毒的抑制作用越显著。甘草酸二铵和甘草酸二钾作为中药提取物,毒性小,抑制病毒的作用明显,可作为治疗SVA的备选药物。纳米银作为重金属,更应考虑其生物安全性,因其可以直接灭活病毒,可以选作研发外用药物的备选药。