近年来，中央和地方政府财政支农支出逐年加大，然而由于财政支农资金投入点多、面广、线长，而一些地区、部门、单位或多或少地存在思想松懈、制度不健全、管理粗放和监管不严等问题，从而导致财政支农资金流失，制约着资金使用效益的提高，使财政支农资金的投入没有达到应有的效果。因此，随着国家财政支农专项资金的支付力度的加大，加强审计监督，评价分析财政支农资金的使用效益，具有重要的现实意义。基于此，笔者试图通过对浙江省临安市财政支农专项资金审计的现状及审计中出现的问题进行分析，在此基础上对加强财政支农专项资金审计作探索性思考。本研究围绕财政支农专项资金审计问题，在界定财政支农专项资金的概念与特点之后，通过对公共财政理论、委托代理理论、审计需求理论等理论分析的基础上，探讨了财政支农专项资金审计的必要性，通过走访有关财政支农专项资金审计部门和被审计单位实地调查分析，分析了临安市研究财政支农专项资金审计的组织体系和人员构成、农业改革政策执行情况审计分析、涉农基础设施建设项目的审计分析、农村财政支农专项资金管理部门的审计分析等现状，揭示了临安市财政支农专项资金审计中存在着资金布局与项目安排不合理，项目建设地的相关政府行为不尽规范，农业专项经济实体管理不规范，对项目财政支农专项资金跟踪监督不力，地方配套财政支农专项资金存在空转，有偿财政支农专项资金不能真正用到项目上等问题及其表现形式，分析了产生这些问题和存在这些问题的原因，提出了完善财政支农专项资金管理的政策和法规、加强项目的立项审计、注重项目全过程审计、强化财政支农专项资金的审计项目管理、改进财政支农专项资金审计的方式方法等加强财政支农专项资金审计的对策与建议。