应用抑制性消减杂交技术筛选p7TP3剪切体1反式激活基因

来源 :西北农林科技大学 西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jinke1983
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丙型肝炎病毒(HCV)的p7蛋白是存在于HCV结构蛋白和非结构蛋白之间的63个氨基酸残基组成的一个小蛋白,它在脂质膜中形成阳离子通道。p7蛋白对病毒颗粒感染性的产生是必需的。利用基因芯片技术对p7蛋白表达载体转染的肝母细胞瘤细胞系HepG2的基因表达谱变化进行了比较,发现p7蛋白可以反式调节某些基因的表达,其中包括一个未知功能基因,命名为p7TP3。在研究p7TP3基因的过程中,发现了p7TP3基因的不同剪切体,对p7TP3基因组进行分析,确定了p7TP3剪切体1的编码序列。为进一步探讨p7TP3剪切体1基因在HCV致病过程中的作用,我们进行了如下研究:1.采用RCR技术克隆扩增p7TP3剪切体1,并以T-A克隆法,将p7TP3剪切体1基因片段连入载体pGEM-T,经EcoR I和BamH I双酶切鉴定以及测序分析,成功克隆了p7TP3剪切体1基因。2.构建荧光表达质粒pEGFP-C1-p7TP3剪切体1,瞬时转染HepG2细胞,并以空载体pEGFP-C1作为平行对照,检测p7TP3剪切体1的细胞内定位。荧光显微镜下观察发现,荧光表达质粒pEGFP-C1-p7TP3剪切体1瞬时转染HepG2细胞后,发现其亚细胞定位于细胞浆中。3.构建真核表达质粒pcDNA3.1/myc-his-p7TP3剪切体1 ,以表达质粒pcDNA3.1/myc-his-p7TP3剪切体1瞬时转染HepG2细胞,并以空载体pcDNA3.1/myc-his作为平行对照,制备转染后的细胞裂解液,应用抑制性消减杂交技术,构建p7TP3剪切体1反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库,筛选相关的靶基因片段,将产物与pGEM-Teasy载体连接,转染E. coli大肠杆菌系统进行文库扩增,随机挑选克隆,PCR扩增后进行测序及同源性分析,筛选得到14种上调基因。结果表明:(1)p7TP3剪切体1蛋白具有反式调节功能。(2)筛选得到的cDNA全长序列,包括一些与细胞内信号转导、细胞生长调节、蛋白质翻译合成、物质代谢、细胞凋亡、免疫调节及肿瘤发生密切相关的蛋白编码基因,推测了p7TP3剪切体1在肝细胞内可能存在的调控机制。
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