随着市场竞争的加剧,技术创新已成为企业生存和发展的重要基础,通过创新来实现新产品的开发,扩大市场份额,提高获利能力和营业利润。而研发活动则是企业技术创新的动力和源泉。然而,与发达国家相比,目前我国企业研发投入水平普遍偏低,一个重要的原因在于溢出效应的存在,尤其是知识溢出,溢出效应属于“市场失灵”,需要政府干预,一般政府通过给予创新补贴来弥补企业损失,刺激企业增加研发投入,使企业成为研发投入的主体,从而促进国家整体创新水平的提高和企业经营业绩的改善。在我国大力推动自主创新、建立创新型国家的背景下,研究政府补助、企业研发投入和公司绩效之间的关系显得尤为重要。本文选取中国生物医药上市公司为研究对象,对政府补助、企业研发投入和公司绩效的关系进行了理论分析和实证研究,并据此提出相关政策建议。选择生物医药产业是基于以下原因：该行业是被广泛认为需要大规模研发投入和产品创新的行业,也是国家重点支持发展的新兴高技术产业之一,医药产业在中国有着广阔的发展前景,且国内目前鲜有专门对这一行业政府补助、研发投入和公司业绩的相关研究。首先,我从理论上分析了政府补贴和企业研发投入的重要性,对国内外相关领域的研究成果进行汇总和综述,并提出本文研究假设。其次,基于2004-2011年我国39家生物医药上市公司的面板数据,构建实证分析模型检验研究假设。本文得出的主要结论有：1、政府补助促进了中国医药上市公司自主研发支出的增长,企业规模对研发支出有不显著的负相关关系,中小规模企业对政府补助反应更为积极；2、企业研发支出是一个动态连续的过程,当期的研发支出会受到上期研发支出的影响；3、公司当期研发投入强度与当期营业利润率呈现不显著的负相关关关系,但与未来营业利润率存在显著的正相关关系,这种正面影响在滞后两年时效果达到最大,说明研发投入强度对营业利润率有滞后性影响。基于实证结论,本文提出以下建议：1、政府应加大对生物医药上市公司的研发补助,推动企业加大自主研发投入,成为研发主体。同时,应当出台一系列优惠的政策措施来鼓励和发展中小生物医药公司的研发活动。2、要进一步完善市场经济体制和各项法律法规,重点加强知识产权保护力度,激励企业持续不断地进行创新投入。3、拓宽医药公司融资渠道,发展债券市场、股票市场和风险投资市场,鼓励更多社会投资者投资医药行业研发活动。4、公司应完善自身体制和制度,建立内部创新激励机制,吸引高层次人才进行主动创新,同时加大与国际知名医药公司和研发机构的合作,实现知识的引进、消化、吸收和再创新。