蛋鸡产蛋的持续性直接且深刻地关系到生产者的经营成本,因此母鸡产蛋后期的产蛋能力(产蛋率),是一个非常重要的经济性状。本研究中课题组挑选了192只京红1号母鸡,进行了全基因组关联分析(GWAS)。通过3种不同统计模型的比对分析,结果均显示,在母鸡的第一号染色体上可能存在多个与母鸡产蛋率性状相关的位点。通过GWAS,对5K范围的候选区域基因进行了KEGG通路富集和GO富集,结果发现,孕酮介导的卵母细胞成熟通路(progesterone-mediated oocyte maturation)中的CDC16,CCNA1和PGR(progesterone receptor)等是首要的候选基因。通过蛋白互作分析,发现:FOXO1,TNFSF11、CNTN5、GPR83等基因与已经报道的明确和产蛋相关的基因存在直接的互作。在全基因组关联分析中,发掘出与产蛋持续性性状显著相关的6个SNP位点(rs314046958,rs13946912,rs15718855,rs312285713,rs13946715,rs316088674),利用1900只处于产蛋后期的已测产蛋率性状的京红蛋鸡群体,采用限制性片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP)对这些SNP位点进行酶切分型和关联分析验证。结果显示rs314046958,rs15718855,rs316088674三个不显示多态性,rs13946912未达到显著水平(P>0.05),而rs312285713,rs13946715与产蛋性状关联极显著(P<0.01)。因此,rs13946715这个位点可以作为产蛋后期的关联标记,但仅用于辅助选择京红一号产蛋后期母鸡。另外rs13946715位于微管蛋白γ复合物相关蛋白3(tubulin gamma complex associated protein 3)基因的第一个内含子上。TUBGCP3基因作为细胞骨架的结构组成及结构分子活性,参与减数分裂的细胞周期和单受精过程,在其他物种上已经得到证实。综上所述,本研究将为京红1号的选择提供一个优质、高效的与产蛋相关的基因标记,该标记将有助于提高母鸡产蛋后期的产蛋性能的选择效率,促进生产发展。