【摘 要】
:
蛋白质是生物体功能的执行者,也是生命科学中重要的研究对象。一切生命活动都离不开蛋白质的参与,每一种蛋白质都有发挥其功能的最佳温度范围,高于或低于这个温度范围,蛋白质的活
论文部分内容阅读
蛋白质是生物体功能的执行者,也是生命科学中重要的研究对象。一切生命活动都离不开蛋白质的参与,每一种蛋白质都有发挥其功能的最佳温度范围,高于或低于这个温度范围,蛋白质的活性就会受到影响,甚至是失活。但是目前在食品、化工,分子设计和生物医学等领域,经常需要在较高温度下仍然能够保持其原有功能的蛋白质,因此,提高蛋白质的热稳定性,了解蛋白质发挥其功能的机制,找出影响蛋白质热稳定性关键因素,已经不仅仅是一个科学问题,在人们的日常生活和工作中发挥了越来越重要的作用。吸引了越来越多的科学家花费大量的时间和精力投入到蛋白质热稳定性的研究中来。
残基突变是提高蛋白质热稳定性的有效途径之一。对于突变位点的预测,目前已经通过蛋白质工程的方法,比如合理设计,组合设计和数据推理等方法,取得了丰硕的成果。但是,如何选择突变位点目前仍然没有完全解决。效率和筛选的有效性还需要进一步提高。
为此,本文采用高温动力学的方法,综合考虑残基间相互作用能量,蛋白质结构以及结构随温度的变化规律等信息,筛选提高蛋白质热稳定性的突变位点。我们从ProTherm数据库中根据特定条件选取了四个蛋白质作为研究对象,分别为:1csp,1qqv,1rop,1pga。以1csp为例,我们分别在Tm,Tm+50k,Tm+100k,Tm+150k温度下作动力学模拟,对模拟结果进行统计分析,选出做动力学模拟最适宜的温度。然后在此温度下对其他三个蛋白质做动力学模拟,根据影响蛋白质热稳定性的因素以及这些因素对蛋白质热稳定性贡献的大小,首先对蛋白质残基进行一个初步筛选,对符合条件的残基,进一步分析残基间距离随时间的变化规律,然后去除保守性残基,进而得到最终结果。
我们的方法所需数据量少,易于实现,并且效率高,具有很好的应用价值。本文研究结果表明静电作用和疏水作用可能是影响蛋白质热稳定性最重要的因素。
其他文献
表面增强拉曼散射(SERS)作为一种分子指纹检测技术可以对物质的结构进行鉴定并且在材料科学、食品科学、生命科学、考古学和农业等领域有着广泛的应用。制备高强度、高灵敏度、制备过程简单和花费低的SERS基底是科技界工作的核心。本篇论文在现有的SERS基底的研究基础之上,针对SERS基底在实际制作过程中制作方法复杂、花费高并难以在实际检测领域对SERS基底进行实际应用的问题进行了深入的研究,本文采用了电
本文利用时域有限差分方法(FiniteDifferenceTimeDomain,FDTD)研究了粗糙地面电磁散射特性及其与目标的复合散射特性。主要包括单层及分层随机粗糙地面的电磁散射、单层及分层
所谓党内民主,简而言之,即指在党的政治生活中,全体党员有一律平等地直接或间接决定和管理党内一切事务的权利。党内民主的实质内涵是党员民主权利的平等,要做到这一点,关键
富勒烯凭借自身优异的物理化学特性,自它被发现以来,一直受到科学界的广泛关注。富勒烯是单质碳的一种同素异形体,是一种由五元碳环和六元碳环构成的凸多面体。目前,人们已经研发了多种制备富勒烯的方法,富勒烯的相关研究和实际应用也得到快速发展。经过深入研究,许多的富勒烯及富勒烯产物已经通过实验获取,并且在材料科学、电磁和能源等多个领域具有潜在的应用。1992年,乌加特教授通过电弧放电法发现了一种新的碳物质,
本论文讨论了Ahlfors正则空间上的齐性测度的绝对连续性,同时刻画了这些齐性测度与A1权的关系;研究了直线上的Moran集类的拟对称极小性和Hausdorff维数;并且描述了加倍测度空间
具有PuNi3结构的La-Mg-Ni系列贮氢合金是近年来研究开发的一种新型高容量电极合金。目前为使该系列合金实现大规模的产业化开发,研究焦点主要集中于如何延长其在碱性电解液中
近年来,人们发现钙钛矿锰氧化物 La1-xTxMnO3(T为碱金属元素,如 Sr,Ca,Ba,Pb等)中具有庞磁电阻(colossal magnetoresistance,CMR)效应,由于它在磁传感器,高速度高密度磁存储
随着社会经济的发展,一系列的环境问题接踵而来,如何充分地利用能源而又有效地降解污染已经成为解决问题的重点,而具有光伏效应和光催化能力的半导体材料就成为解决问题的突破点。半导体材料产生光伏响应并参与光催化过程主要依靠于光生电荷分离、迁移及复合过程。以上光生电荷的行为一般发生在半导体的表面,研究半导体表面光电性质可以引导光伏响应和光催化效率的提高。PbI_2为p型半导体材料,禁带宽度较大,约为2.4
网络化、数字化、智能化推动着信息化的巨大进展,特别是云计算、大数据等新一代技术正在得到广泛应用。当今的媒体传播,新媒体以其强大的传播能力,改变着整个媒体环境状态,各
低压低温等离子体作为重要的材料加工手段,在微电子、显示技术、超大规模集成电路工艺以及新材料等领域中得到广泛应用。其中在等离子体化学气相沉积技术(PCVD)薄膜制备过程