底泥扰动是自然水体中沉积物内源磷再生和形态转化的重要影响因素。但从目前研究来看,底泥扰动对内源磷再生和形态转化的作用机制尚未完全明确。同时,以往的研究多专注于截除外源磷的条件下,扰动对水体内源磷在泥水界面的迁移转化过程及其在不同形态磷中的分布。尽管实际水体中外源磷输入逐渐得到控制,但两者却仍是共同存在的,且在进入水体后难以捕捉该部分磷在泥水两相之间,特别是泥相不同形态磷间的转化过程。另外,先前的此类研究更多的是采用传统的化学分析法对上覆水和沉积物的磷形态进行含量测定,关于内源磷形态的转化路径仅是依靠数量增减关系进行理论推测,并不能提供泥水两相中磷转化路径的直接证据。同时,底泥扰动势必会引起底泥微生物的变化,而微生物的变化对内源磷固定的影响是积极还是消极的尚未可知。因此,有关外源磷持续输入条件下扰动引起的微生物变化及其对磷控制的影响仍需进一步深入研究。本研究以京杭大运河（苏州段）为研究对象,通过不同断面的采样对其磷污染现状进行全面的调查分析。此外,利用室内模拟实验,通过32P同位素示踪法和高通量测序的分子生物手段,探讨在长时间扰动过程中微生物的变化以及其对外源磷进入水体后内源磷形态的影响。京杭大运河（苏州段）的磷污染调查分析结果表明,与居民区和风景区附近采样点相比,污水处理厂尾水排放口附近的沉积物内源负荷更大,扰动下,内源磷更容易释放到上覆水中。在水质较差常年受污水厂尾水排放影响的断面,实际形成了物理与水丝蚓的组合扰动模式,显著改变了该断面上覆水中不同形态磷的数量分布。扰动状态下,采样点沉积物Fe/Al-P和Ca-P均有所增加,而NH4Cl-P有所释放,Res-P未见明显变化,且改变随着深度的增加而减少。并且,污水排放口处采样点,扰动所引起的物理扰动对京杭大运河（苏州段）沉积物内源磷形态转化的促进作用更为明显。32P同位素示踪室内模拟实验的结果表明,扰动均能促进外源磷由上覆水向底泥迁移,但物理扰动的促进作用更加明显。不同形态磷的形成有明显的时间顺序。外源磷更易于形成弱吸附态磷（NH4Cl-P）,但随着物理扰动时间延长,则强化了弱吸附态磷向难释放态磷（Ca-P）的转化。通过采用高通量测序技术对不同扰动条件下底泥微生物群落进行分析可知,底泥扰动对底泥微生物菌落结构有明显影响。即物理扰动、生物扰动以及组合扰动均会在一定程度上增加底泥微生物丰度,同时也会减少微生物的多样性,主要表现为增加优势菌群占总微生物量的比例。另外,物理扰动组中厌氧绳菌科（Anaerolineaceae）明显低于空白组、生物扰动组和组合扰动组,这表明底泥在物理扰动条件下,底泥厌氧环境得到较大改善,从而使得厌氧绳菌科微生物丰度减少。底泥扰动会在一定程度上增加Acinetobacter和Pseudomonas这两种聚磷菌丰度,将有利于底泥中磷的固定。RDA分析结果表明,Fe/Al-P和Ca-P均与硝化细菌,酸性细菌的丰度呈正相关,而NH4Cl-P与硝化细菌相关性较小。硝化细菌作为对氧环境有明显要求的细菌,其在底泥扰动条件下丰度的增加,再结合其与NH4Cl-P、Fe/Al-P和Ca-P三种磷形态的相关性关系可以看出,该细菌有利于底泥中NH4Cl-P向Fe/Al-P和Ca-P这两类更稳定的内源磷形态转化。不动杆菌作为典型的解磷菌,其会导致底泥中磷解析释放被利用的潜在风险。底泥扰动所引起的不动杆菌丰度的减少以及NH4Cl-P、Fe/Al-P和Ca-P和其相关性表明,底泥扰动条件下不动杆菌减少,这可有效减少底泥内源磷向水体释放,换言之,即对内源磷控制是有益的。