拟南芥MicroRNA通路新因子的鉴定和作用机制研究

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MicroRNA (miRNA)是一类大约21个核苷酸长的小RNA(small RNA, sRNA),在很多生物学过程中起着重要的调节作用。niRNA的产生过程包括由PolⅡ转录出其前体(primary miRNA, pri-miRNA)和由Dicer-likel (DCL1)对pri-miRNA进行加工形成成熟的niRNA两个过程。miRNA与ARGONAUTE1(AGO1)结合形成RNA沉默复合物(RNA-Induced Silencing Complex, RISC),主要通过切割靶基因mRNA或抑制翻译调节基因表达。为了加深我们对miRNA通路机制的理解,我们利用一个高效表达可使拟南芥表皮毛成簇的人工miRNA的转基因系,建立了针对miRNA通路的遗传筛选体系。通过诱变筛选,我们得到了一些miRNA活性增强(enhanced miRNA activity, ema)或减弱(compromised miRNA activity, cma)的突变体。在本研究中,我们鉴定和研究了cma33突变体。CMA33编码一个核蛋白XCT (XAP5CIRCADIAN TIMEKEEPER), XCT之前被发现调节植物的节律和乙烯反应。uma33/xct突变体中,miRNA以及另外两类sRNAs,依赖于DCL3的heterochromatic siRNA (hc-siRNA)和依赖于DCL4的trans-acting siRNA (ta-siRNA)的积累都下降。进一步我们发现cma33/xct突变引起了DCL1、DCL3和DCL4表达量的下降。与此相一致,cma33/xct突变体中PolⅡ在这三个DCL基因上的结合减少,这意味着XCT通过调控DCL1、DCL3和DCL4的转录调节sRNA的生成。我们之前报道的EMA1编码一个importin β家族蛋白,可以负调节niRNA进入AGO1的过程。在本研究中,我们进一步以emal突变体为材料,进行了emal的抑制子筛选(suppressor of emal, soe),以更敏感地获得调节miRNA产生和活性的新因子。我们分析了其中两个突变体:soel和soe2。SOE1和SOE2分别编码了ELP2和ELP5,它们是高度保守的Elongator复合物的两个亚基。我们发现,在soel和soe2突变体中,PolⅡ在编码miRNA基因上的结合量下降,部分pri-miRNA的积累下降,说明Elongator可以促进MIR的转录。此外,Elongator与负责pri-miRNA加工的Dicing复合物相互作用,而且Elongator的缺失影响DCL1的定位,说明Elongator参与pri-miRNA的加工。更有意思的是,我们发现pri-miRNA转录本和DCL1都富集在染色体上;并且,DCL1与染色体的相互作用依赖于Elongator复合体的存在。我们的结果说明植物中pri-miRNA的转录和加工是偶联的,而Elongator很可能作为偶联的桥梁,使pri-miRNA的加工更加高效、有序。
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