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柑橘是世界上第一大水果。培育适合市场和消费者需求的优质品种是全世界柑橘工作者所面临的重要课题。目前，育种家们把柑橘接穗品种选育的目标主要定位在无核、特早熟或特晚熟等性状上。柑橘种质资源尤其是优良类型和品种是柑橘育种的基础和发展生产的前提。‘秭归橘橙’是在湖北省秭归县发现的天然柑橘杂种，其果肉、果皮均为橙黄色，表现为无核、早熟。因此，‘秭归橘橙’具有开发成为特早熟杂柑优良品种的潜力。为探明‘秭归橘橙’的遗传背景，找出其最可能的亲本，为‘秭归橘橙’的开发、利用提供理论依据。本研究应用形态学标记和AFLP、cpSSR、nSSR等分子标记，对其进行遗传鉴定。主要结果如下：1．‘秭归橘橙’的叶型指数(1.70)比红橘(Citrus reticulata Blanco) (2.01)、锦橙[C．sinensis(L．)Osbeck](2.15)的叶型指数小，且差异显著，与哈姆林甜橙[C．sinensis(L．)Osbeck](1.78)的叶型指数无显著差异；气孔密度(314.25个／mm~2)比红橘(391.06个／mm~2)、锦橙(409.69个／mm~2)、哈姆林甜橙(470.21个／mm~2)的气孔密度小，且差异显著。‘秭归橘橙’与红橘、锦橙、哈姆林甜橙相比气孔纵、横径小，但纵横径比无显著差异。这充分说明，‘秭归橘橙’的叶片比橘和甜橙的叶片圆，气孔密度低，气孔纵横径小，但气孔的形状无明显差异。2．‘秭归橘橙’的花粉染色活力(44.0％)介于红橘(71.1％)和锦橙(43.8％)之间，与红橘的花粉染色活力有显著差异，与锦橙的花粉染色活力无显著差异。秭归橘橙的花粉直径(29.9μm)比红橘(25.7μm)和锦橙(26.4μm)的花粉直径都大，差异显著。3．花粉形态的电镜扫描图显示‘秭归橘橙’、锦橙、红橘和金钱橘(Citrusreticulata Blanco)的花粉形状相似，为近球形或近扁球形。它们均为网状饰纹。‘秭归橘橙’和锦橙的饰纹很像，网脊线很宽，内孔横长，大小一致；而红橘、金钱橘与‘秭归橘橙’的饰纹不一样，网脊线特宽，内孔圆形，大小不一致。因此推断‘秭归橘橙’与锦橙有较近的亲缘关系。4．经AFLP鉴定：‘秭归橘橙’和锦橙、桃叶橙等甜橙的带型很相近。AFLP聚类分析又显示‘秭归橘橙’的聚类位置处于红橘和甜橙之间；经cpSSR鉴定证明‘秭归橘橙’的cpDNA与甜橙、柚[C．grandis (L．) Osbeck]的一致，而与红橘、大浦蜜柑等宽皮橘的cpDNA不一致。由此推测，‘秭归橘橙’的母本可能来源于甜橙(或柚)；nSSR分析表明，‘秭归橘橙’在TAA15上带最少，且同时具有桃叶橙、哈姆林甜橙、锦橙与红橘的带。因而推断该杂种的父本可能来源于橘。综合以上结果我们推测‘秭归橘橙’的母本为甜橙，父本为橘类。