一个拟南芥晚花突变体的定位与分析

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开花是植物由营养生长向生殖生长转换的一个重要转折点。在模式植物拟南芥中,开花启动至少受光周期途径、春化途径、自主途径和赤霉素途径等四条途径的调控。这个调控网络的复杂性有必要分离更多的开花时间突变体以更好的理解开花调控的遗传和分子基础。本实验室以Columbia型拟南芥为材料,通过EMS诱变筛选到一个晚花突变体,命名为flowering locus r(flr)。本研究对此突变体的遗传背景进行了纯化,构建了作图定位群体,对突变基因进行了定位。  为了纯化突变体的遗传背景,我们以野生型(Columbia ecotype)为母本,突变体(Columbia ecotype)为父本进行杂交,这样发生在叶绿体和线粒体基因组中的突变就会去除。种植杂交一代(F1),F1自交产生子二代(F2),从F2中选择晚花表型的突变体,纯化突变体的遗传背景,以减少额外突变对后续工作的影响。  为了构建作图群体,将突变体flr与不同遗传背景的Ler生态型杂交,收获子一代(F1)种子,F1自交产生子二代(F2),从F2中选择具有晚花表型的突变体作为定位群体。提取群体中每一晚花突变体的基因组DNA,进行基因型分析。利用已知的和自己创制的SSLP分子标记对群体进行了基因型分析。通过连锁关系分析,该基因位于分子标记NGA106和T20D1-6801之间。  本实验室前期的研究表明,此突变体的FLC表达量增加。在拟南芥开花调控网络中,除了自主途径基因突变解除对FLC表达的抑制以外,有功能的FRI也能促进FLC的表达。对FRI的克隆测序表明该突变体的FRI与处于失活状态的Columbia生态型基因序列完全一致。所以,我们认为突变体的晚花表型与flr的突变,而不是FRI的变化相关。
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