科技进步作为经济发展中越来越重要的生产要素，其对经济发展的作用不仅体现在对经济增长的贡献率、产业结构调整、知识经济的兴起和发展上，而且通过经济增长理论、技术创新理论、国家创新体系理论的研究也在理论上得到了进一步的论证和重视。在经济全球化及科技经济一体化发展趋势的大背景下，如何有效地配置科技资源，使科技与经济更有效地结合，已成为各个国家或地区共同关注的课题。西部地区作为我国经济发展的重要组成部分，其经济的繁荣关系到整个国家经济的腾飞。世纪之交，西部大开发战略的提出无疑是西部经济实现飞跃发展的大好机遇，但此次西部大开发的时代背景、战略重点及可持续发展的长远目标决定了开发必须一改往日传统开发模式而转向依靠科技促开发。针对西部科技与经济未能协调发展的现状和特点，通过对制约西部科技经济发展的传统科技体制这一主导因素的弊端分析，以及对科技体制改革的现状分析，文章认为为21世纪西部经济发展提供强力科技支撑的途径在于科技体制创新。提出制度创新乃是深化科技体制改革的路径依赖：采用政府强制性制度变迁方式推进科技体制向市场化进化，在具体策略上突破改革从中央或国家所属科研部门开始的思路，结合地方科技经济发展特点，主张建立“科技体制改革西部试点区”，让科技体制市场化改革首先在西部的陕西、四川两省实现，从而促进和带动西部科技与经济的有效结合，并且进一步探讨了西部科研机构转制的模式。由于这一改革牵扯到许多方面的配套改革，在改革过程中也会存在一些矛盾，因此，建设和完善西部区域创新体系则又成为进一步深化科技体制改革的有效途径和方法。