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1.对棉属的遗传变异进行探索,特别是陆地棉各种系,有利于拓宽商业化的栽培棉品种现有的狭窄遗传基础。因此,本研究的目的是评估270份棉花材料的遗传多样性,包括266份半野生棉和1份陆地棉品种CR112,以及其它三个栽培品种海岛棉、亚洲棉和草棉分别各1份。总共筛选了1040对SSR引物,其中355对(34.13%)表现为多态性。其中,选择了均匀分布在整个棉花基因组中的202个标记用于进一步分析。共检测出1256个多态性位点,每个SSR标记的等位基因数范围从2至14,平均为6.22个。SSR标记DPL0810,HAU1171, MON_CGR6170和NAU1043有最高等位基因数,多态性率为0.93。标记的PIC值介于0.02(GH649)～0.93(HAU1171)之间,平均值为0.65。167个SSR标记(82.67%)的PIC值≥0.50,22个(10.89%)的PIC值在0.25和0.50之间,13(6.44%)个的PIC值<0.25。有效等位基因数介于1.02至13.67,平均值为3.63。Shannon多样性指数范围从0.06到2.70,平均为1.31。总共检测到66个等位基因,频率小于1%。野生型陆地棉种质间的Jaccard相似系数为0.23-1.00,均值为0.46,揭示了种质间广泛存在的遗传多样性。玛丽加郎特棉是最特异的,平均遗传相似性为0.48,且特异的等位基因较多(34)。尤卡坦棉表现出最高的平均遗传相似系数(0.97)。15种种质表现出的相似系数等于1。阔叶棉与CRI12棉种相似性最高。等位基因的数量之多证实了SSR分子标记在评估半野生棉种质之间的遗传亲缘关系的有效性。2.对91个陆地棉种质和CRI12进行了关于农艺和纤维品质性状评价。多于一半种质的纤维平均长度介于17.95(莫利尔棉)到35.88毫米(玛丽加朗特棉)之间,平均值为24.80毫米。纤维细度差异显著,马克隆值平均为4.46。玛丽加朗特棉纤维较细(3.40),阔叶棉53纤维较粗(5.68)。尖斑棉16和玛丽加朗特棉117有最大纤维伸长率(6.80%),而莫利尔棉23,莫利尔棉38,玛丽加朗特棉104,阔叶棉6和雷奇蒙地棉1有最小的纤维伸长率(4.90%)。种质间的平均纤维伸长率是6.02%。尖斑棉3的纤维均匀性最差(63.40%),玛丽加朗特棉94的纤维最均匀(99.30%),平均81.70%。衣分从最低17.03(玛丽加朗特棉107)到最高41.82(CRI12),次高是39.87(阔叶棉25),平均值为27.5%。有28个种质有较长的纤维,38个种质有较低的马克隆值值,7个种质具有较强的纤维,31个种质较中12具有较高的纤维伸长比。这些种质的收集为改善现有棉花品种纤维品质性状提供了宝贵的遗传资源。种质间株高介于87.20(阔叶棉136)至198.60厘米(玛丽加朗特棉3),平均值为134.52厘米。阔叶棉65第一果枝节位最低(3),玛丽加朗特棉65最高(12.60),平均值为6.86。在所有的种质间,阔叶棉平均株高最矮(122.06厘米)且第一果枝节位最少(5.23)。阔叶棉23果枝数最少(13.2),而玛丽加朗特棉最高(35),平均值为23.55。以50%开花的天数为开花期,种质间的开花期从67天(阔叶棉35)到149天(玛丽加朗特棉83),平均为95.27天。籽棉产量与皮棉(0.99)和衣分(0.57)呈显著的正相关。衣分与皮棉产量(0.62)和马克隆值(0.25)呈显著正相关。株高与果枝数(0.59),第一果节数(0.50),开花日数(0.25)呈现显著的正相关。第一果枝节数与开花期(0.56)呈显著正相关,但与马克隆值(-0.42)、籽棉(-0.33)、皮棉(-0.28)和衣分(-0.33)呈显著负相关。果枝数与第一果枝位数(0.50)、开花日数(0.60)、上半部平均长度(0.29)和纤维伸长率(0.27)呈显著正相关,并与马克隆值(-0.21)、籽棉(-0.41)、皮棉(-0.35)和衣分(-0.36)呈显著负相关。开花期与上半部平均长度(0.21)呈显著正相关,与马克隆值(-0.25)、籽棉(-0.42)、皮棉产量(-0.35)、衣分(-0.35)呈负相关。上半部平均长度均与均匀性指数(0.64),纤维伸长率(0.88)呈正相关,但与马克隆值(-0.27)显著负相关。纤维整齐度与上半部平均长度(0.64)、纤维伸长率(0.55)呈正相关。表型欧氏距离介于0.89至7.17之间。在4.34欧氏距离处,种质被分为7集群。表型数据分析显示了农艺和纤维品质性状多样性广泛存在半野生棉种质中。