【摘 要】
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目的:通过对变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)患者血清外泌体来源的特异性circ RNA表达谱进行分析,筛选出参与到AR发生发展过程中的circ RNA,并探究其作用机制,为AR的精准诊疗提供理论依据及新的研究方向。方法:收集2020年6月至2020年12月经泰州市人民医院耳鼻咽喉科确诊为变应性鼻炎且符合纳入标准的5例患者为AR组,另选5例同期非AR(如甲状腺肿物、会厌囊肿、鼻
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目的:通过对变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)患者血清外泌体来源的特异性circ RNA表达谱进行分析,筛选出参与到AR发生发展过程中的circ RNA,并探究其作用机制,为AR的精准诊疗提供理论依据及新的研究方向。方法:收集2020年6月至2020年12月经泰州市人民医院耳鼻咽喉科确诊为变应性鼻炎且符合纳入标准的5例患者为AR组,另选5例同期非AR(如甲状腺肿物、会厌囊肿、鼻出血等)患者为对照组。采集这10例入组患者外周血各10m L进行血清外泌体的提取,获取血清外泌体中总RNA,进行逆转录及测序,筛选出特异性circ RNA,并进行GO、KEGG富集分析,构建circ RNA-mi RNA关系作用网,通过既往已有的mi RNA靶基因研究结果,发现与之对应的circ RNA的功能及作用机制。结果:1.外泌体:将提取出的外泌体样本置于电镜下观察,可以观察到样本中的外泌体呈双层囊泡样结构,直径在40-100nm之间,这些外泌体的观察结果均与之前的报道相符。2.AR组及对照组血清外泌体测序结果显示:显著性差异表达的circ RNA共66个,其中上调基因28个,下调基因38个。3.GO富集分析结果:生物过程主要富集于:信使RNA的剪接、翻译后的蛋白质修饰、DNA模板的调节转录、DNA模板的转录等;细胞成分主要富集于:线粒体、细胞外的外泌体、高尔基体、中心体、次级内体膜、细胞质膜、溶酶体膜、细胞质中细胞核周区域以及线粒体内、外膜等;分子功能主要富集于:物质(DNA、RNA、相同蛋白之间、锌离子、其他金属离子)的结合以及蛋白质同源二聚化等。4.KEGG富集分析结果:circ RNA富集于wnt信号通路、神经营养蛋白信号通路、多种癌症中的通路、Th17细胞分化、T细胞受体信号通路等。5.本研究依据circ RNA-mi RNA相互作用对及circ RNA相对应mi RNA的功能注释筛选出3个circ RNA:circ RNA_3771、circ RNA_4405(hsa_circ_0109541)及circ RNA_0111(hsa_circ_0000033)。其中,circ RNA_3771与8个mi RNA相互作用,circ RNA_4405与16个mi RNA相互作用,circ RNA_0111与2个mi RNA相互作用。结论:1.本研究筛选出变应性鼻炎患者血清外泌体来源circ RNA的特异表达谱,这些外泌体特异性circ RNA以各种作用机制参与了AR的发生发展,有望为AR的预测、发病机制、预后判断及治疗提供新的指标。2.本实验筛选出circ RNA进行circ RNA-mi RNA基因互作分析显示:circ RNA_3771、circ RNA_4405、circ RNA_0111可为AR通路机制的阐明提供新的思路。
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