常见的基础网络支撑着整个经济和社会活动，提供了商业，科学，技术，社会系统以及教育所需的各种基础设施。而无形的逻辑网络，也是基础网络的有力补充，帮助人们完成更为复杂的活动或任务。网络结构无处不在，他们的作用超乎想象，离开了网络，人类将无所适从。 　　由于网络系统在人类生活占据着越来越重要的地位，其效率就显得尤为重要。然而，在网络系统中，参与的实体数量很多，各自拥有自己的行为方式和目的，网络经过长期的运行，所达到的静态用户均衡，只是每一位网络用户不能通过单方面的行动改善自己的状况而已。网络系统作为一个整体，在大多数情况下，并不能够达到系统整体的最优。所以，做为政府或者网络决策者，有义务采取一定的措施控制网络系统，使其能够达到系统的优化，这一背景引发了本文的研究。 　　本文研究的主要基础是网络均衡理论，即静态用户均衡的一系列均衡条件及求解模型。站在政府决策者的角度，试图利用道路收费政策来控制网络结构达到理想的用户均衡状态。文中主要对两类网络进行了介绍及分析，交通网络和供应链超级网络。对交通网络中负的外部性，尾气污染造成的环境问题通过道路收费进行控制。在其成本函数可分离的情况下，利用尾气污染定价和双层规划模型达到了两种不同的控制目标，即使尾气污染不超过某一限制标准和污染最小化的目的。在网络为非对称的情形下，建立了下层为变分问题的双层规划，利用罚方法对其求解进行了分析。对于供应链超级网络，目的是通过交易税收，对各个交易路线上的单位交易量收取一定的税收，各不相同，使得网络系统中实体总的效益最大化，文中是使得所有生产厂商和零售商的利润之和最大。同样建立了下层为变分问题的双层规划，并用实例分析了税收政策的有效性。总之，本文的主要贡献在于，提出网络系统道路收费政策利用双层规划模型确定最优控制目标，并在双层规划模型下分析了求解方法，这一最优化的系统目标也为决策者提供一定的决策依据。