【摘 要】
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自然发酵乳制品的制作历经千年传承,蕴藏着丰富的微生物资源。本研究以采集自塔吉克斯坦地区的7份自然发酵酸牛乳样品为研究对象,通过PacBio SMRT测序技术分析自然发酵酸牛乳中的乳酸菌生物多样性,并对其中的乳酸菌进行分离、鉴定和保藏,最后对代表性菌种进行遗传多样性分析,主要研究结果如下:（1）基于PacBio SMRT测序技术分析发现,塔吉克斯坦地区自然发酵酸牛乳中的细菌共分为2个门,6个属,15
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自然发酵乳制品的制作历经千年传承,蕴藏着丰富的微生物资源。本研究以采集自塔吉克斯坦地区的7份自然发酵酸牛乳样品为研究对象,通过PacBio SMRT测序技术分析自然发酵酸牛乳中的乳酸菌生物多样性,并对其中的乳酸菌进行分离、鉴定和保藏,最后对代表性菌种进行遗传多样性分析,主要研究结果如下:（1）基于PacBio SMRT测序技术分析发现,塔吉克斯坦地区自然发酵酸牛乳中的细菌共分为2个门,6个属,15个种。7份酸牛乳样品中的主要细菌菌种为Lactobacillus delbrueckii（82.02%）、Streptococcus thermophilus（7.36%）和Lactobacillus helveticus（6.62%）。与前期研究相比,塔吉克斯坦地区自然发酵酸牛乳中Lactobacillus delbrueckii占绝对优势,细菌组成相对单一。（2）7份样品共分离得到89株乳酸菌,鉴定为3个属7个种。其中79株Lactobacillus delbrueckii,占所有分离株的88.76%,是样品中的优势菌。另有Lactobacillus plantarum占3.37%,Enterococcus faecium占3.37%。（3）将43株代表性菌株Lactobacillus delbrueckii与26株NCBI已公布的基因组数据构建了613个核心基因集和11254个泛基因集,系统发育树的3个分支位其不同的亚种,分别为Lactobacillus delbrueckii subsp.indicus、Lactobacillus delbrueckii subsp.lactis和Lactobacillus delbrueckii subsp.bulgaricus,且呈现出一定的地域聚集性。其中Lactobacillus delbrueckii subsp.indicus分布在Arka地区,Lactobacillus delbrueckii subsp.indicus和Lactobacillus delbrueckii subsp.lactis在Fapm地区聚集,Lactobacillus delbrueckii subsp.bulgaricus主要在Chad地区。本研究通过多组学联合的方法对塔吉克斯坦自然发酵酸牛乳样品中的乳酸菌多样性进行解析,分离、鉴定并保藏了89株乳酸菌,从基因组水平揭示了该地区代表性菌种Lactobacillus delbrueckii的遗传多样性与物种多样性,为自然发酵乳制品中乳酸菌资源的进一步开发利用提供了参考数据。
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