【摘 要】
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基因突变是指基因组中核苷酸序列发生的改变,是生物进化的内在动力。在DNA和RNA分子水平上理解碱基变异的过程是生物进化学的重要组成部分。在对基因突变的研究中发现,单个核苷酸的突变会受到其上下核苷酸的影响。全上下核苷酸影响下的基因突变模型在模拟基因序列的进化过程中引入了定量化的上下核苷酸的影响参数。因此,本文利用该模型对RNA序列的变异进行了分析和研究。主要工作如下:首先,在全上下核苷酸影响下的基因
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基因突变是指基因组中核苷酸序列发生的改变,是生物进化的内在动力。在DNA和RNA分子水平上理解碱基变异的过程是生物进化学的重要组成部分。在对基因突变的研究中发现,单个核苷酸的突变会受到其上下核苷酸的影响。全上下核苷酸影响下的基因突变模型在模拟基因序列的进化过程中引入了定量化的上下核苷酸的影响参数。因此,本文利用该模型对RNA序列的变异进行了分析和研究。主要工作如下:首先,在全上下核苷酸影响下的基因序列突变模型的基础上,用数学表达式定义了一个基因序列的变异率,使序列的变异率变得定量可算。通过计算不同物种的基因组的编码RNA和非编码RNA序列的变异率,发现编码RNA和非编码RNA在变异率方面具有不同的特征。其次,通过计算RNA病毒基因序列中双核苷酸Cp G的表达量,发现大多数RNA病毒基因序列中存在着双核苷酸Cp G表达不足的现象。同时利用全上下核苷酸影响下的基因序列突变模型对RNA病毒基因序列的变异过程进行了动态模拟,并对包括新型冠状病毒（SARS-Co V-2）在内的RNA病毒基因序列的变异率进行了计算和分析,发现不同RNA病毒在非外界影响下的序列自身变异率存在着差异。
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