重组溶瘤2型单纯疱疹病毒荧光定量PCR检测方法的建立、验证及初步应用

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目的:建立效率高的、灵敏的针对溶瘤2型单纯疱疹病毒(Oncolytic herpes simplex virus type 2,oHSV2)的荧光定量PCR方法,依据中国药典的方法学验证指导原则对该PCR方法进行初步的验证,并检测给药后小鼠肿瘤组织内粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(granulocyte-macrophage colonystimulation factor,GM-CSF)的表达。方法:(1)分析oHSV2的全基因组序列,根据它的GM-CSF基因片段,登录Beacon Designer8.0软件设计一对特异性高的引物。提取前期已经重组好的阳性质粒pHG52d34.5CMVhGM-CSF,超微量分光光度计测定该质粒的浓度,并根据公式换算成拷贝数,将其梯度稀释为荧光定量PCR的模板。建立标准曲线,做该方法的特异性、敏感性和重复性试验。(2)采集捐献者的血液和尿液,与103、104、105.5、106.5 copies/μL pHG52d34.5CMVhGM-CSF混合后用QIAamp DNA Mini kit提取总DNA并进行SYBR Green real-time PCR反应,初步验证该方法。(3)裸鼠人恶性黑色素瘤细胞(A375)细胞系植瘤,待瘤子长到一定体积后瘤内给予oHSV2,分别于24 h、48 h、72 h、96 h针吸取样,并提取样本的RNA,反转录后进行PCR检测。结果:oHSV2最低检测限为103 copies/μL,标准曲线方程:y=-3.283log(x)+40.328,R2可达0.998,批内及批间变异系数分别为0.357%1.156%和1.06%3.35%,血液中预加的质粒的回收率为96.6%109.3%,尿液中预加的质粒的回收率为96.9%104.7%。24 h、48 h、72 h、96 h的肿瘤样本可以检测到GM-CSF的表达,96 h的样本结果低于检测下限。结论:(1)建立了针对oHSV2的荧光定量PCR检测方法,可以为后续的临床试验提供理论以及技术上的支持。(2)检测oHSV2的PCR方法通过验证(3)该方法能够检测到给药后小鼠肿瘤组织内GM-CSF的表达情况。
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