水稻、黄瓜、大刍草细菌人工染色体文库的构建与分析

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本文对水稻、黄瓜、大刍草细菌人工染色体文库进行了分析。本研究以濒临绝种的多年生大刍草为材料,以plndigoBAC5为载体,构建了细菌人工染色体文库(BAC)该文库是目前首个大刍草BAC文库。该文库目前共有20 000个转化子,插入频率90%,插入片段平均长度为110Kb。由此推测这个文库覆盖大刍草基因组约0.8倍。利用这20 000个转化子,建立了四维PCR筛选体系,并且通过4维PCR筛选体系。通过筛选,获得了含有玉米重要储藏蛋白22kD α-醇溶蛋白基因的2个BAC克隆。对其中一个22kD α-醇溶蛋白的BAC克隆构建鸟枪测序文库并测序,获得了大刍草的118Kb基因组大片断序列。比较分析表明大刍草floury-2同源染色体区段与玉米对应染色体区段有显著不同,利用基因预测软件发现在这些同源度较低序列中大多为反转座子。
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