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应用生物信息学的方法,分析Nanog, Oct4, Sox2在干细胞保持全能性中的作用,分析Nanog, Oct4, Sox2的调控机制,具体内容如下:1用Nanog, Oct4, Sox2结合靶序列,在所建小鼠胚胎干细胞中转录调控基因数据库中查寻,筛选出研究较少、具有生物信息学分析价值的Nanog靶基因Zbtb9, Shox2, Foxn2, Dmrt2; Oct4靶基因Ascl4, Uimc1, Arid2, Asb1; Sox2靶基因Zfy2, Tcea2, Tcfcp2。2通过对靶基因的基本性质和结构进行分析得出:Zbtb9, Uimc1, Zfy2可能是跨膜蛋白,Shox2, Foxn2, Dmrt2, Ascl4, Arid2, Asb1, Tcea2, Tcfcp2可能是核内蛋白,这些基因蛋白富含疏水性氨基酸,以螺旋为主。利用生物信息学软件分析这些靶基因蛋白含有的结构域。3通过对基因的启动子区域进行分析得出:(1) Nanog, Oct4, Sox2的结合靶序列位于对应靶基因启动子区的附近,或启动子区与转录起始位点之间,或启动子区内,表明Nanog, Oct4, Sox2分别对其靶基因进行转录调控。(2)多数靶基因的启动子区域内含有JCV和AP-2的结合位点,表明所选靶基因在干细胞的自我更新中起作用。(3)在靶基因启动子区内找到Sp1, NFI, H4TF1, junB等结合位点,根据Sp1, NFI, H4TF1, junB基因在特异性细胞转录调控中的作用推断出:Uimc1, Tcfcp2在神经细胞的形成中起作用;Ascl4, Arid2, Foxn2, Dmrt2, Tcea2在内皮细胞的形成中起作用;Ascl4,Tcea2在肌肉细胞的形成中起作用;Zfy2在角质细胞的形成中起作用。4通过分析得出:Nanog, Oct4调控的基因在肌肉细胞和内皮细胞的分化中起作用;Sox2调控的基因在神经细胞和角质细胞的分化中起作用。Nanog, Oct4, Sox2对靶基因的调控之间存在串扰。根据上述分析构建干细胞保持全能性的调控网络。