牛能量代谢相关四个基因的遗传特征分析

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17β-HSD8,ANGPTL4,ANGPTL3和]LXRα是与脂肪代谢、糖代谢和能量代谢密切相关的蛋白质因子。本研究利用实时荧光定量PCR方法检测牛17β一HSD8、 ANGPTL4和LXRα基因在郏县红牛不同组织的表达谱;采用DNA池测序、PCR-RLFP和]PCR-SSCP技术,对候选基因部分序列的遗传多态性进行检测,并分析其与牛生长性状和肉质性状的相关性,旨在探索候选基因与牛经济性状性状的联系。本研究得到以下结果:1.牛17β-HSD8、LXRα和ANGPTL4基因的实时定量表达分析17β-HSD8基因在郏县红牛肝脏和繁殖器官中表达量较高。ANGPTL4基因在郏县红牛的脂肪和肝脏组织表达量较高。LXRa基因在郏县红牛肝脏、脾脏和脂肪组织中表达量较高;在肾脏和肺脏组织中表达量适中。2.牛17β-HSD8基因SNPs与牛经济性状的关联分析发现牛17β-HSD8基因中存在3个SNPs(153(A/G).309(A/G)和1808(A/G)(NC007324.5)).关联分析结果显示:153(A/G)位点的A等位基因与体重(0、6月龄)、胸围(6月龄)和平均日增重(6月龄)显著相关(P<0.05)。309(A/G)位点的G等位基因与体高、体斜长、胸围、体重、重高比、十字部高、胴体嫩度和眼肌面积指标显著相关(P<0.05);1808(A/G)位点的G等位基因与体高、十字部高和胴体眼肌面积显著相关(P<0.05);1808(A/G)位点G等位基因与坐骨端宽(6、12月龄)、体重(24月龄)和平均日增重(24月龄)显著相关(P<0.05)。3个多态位点不同基因组合型中GGAGAG基因组合型与胴体背膘厚显著相关(P<0.05)。3.牛ANGPTL3基因启动子区SNPs与黄牛生长性状的关联分析在牛ANGPTL3基因启动子区共检测到2个SNPs(-271(T/C)和-38(T/C),(NC007301)。关联分析结果显示:-38(T/C)位点的T等位基因与体重(0、24月龄)、坐骨端宽(6、12、18和24月龄)、胸围(24月龄)和日增重(24月龄)显著相关(P<0.05)。4.牛:ANGPTL4基因第一外显子突变检测本实验在牛ANGPTL4基因第一外显子区检测到2个SNPs(为465(T/C)和487(T/C),(NC007305.4)).5.牛LXRa基因突变在郏县红牛群体中的验证选择牛LXRa基因编码区4个突变(1028(T/C)、1514(T/C)、2929(G/A)和3493(T/C))(NC007305.4)为候选突变,候选突变与89头郏县红牛不同月龄生长性状关联分析结果显示:1514(T/C)位点TC基因型个体的体高(12月龄)和体长(12、24月龄)显著地高于CC基因型个体(P<0.05);1208(T/C)和1514(T/C)位点的TC-TC和TT-TC组合基因型个体的体高(12月龄)、体长(12月龄)和胸围(18月龄)显著地高于CC-CC和TC-CC组合基因型个体(P<0.05);四个位点的TCTCGGTT和TTTCGGTT基因组合型个体的体斜长(6、12月龄)和胸围(12月龄)显著地高于CCCCGGTT和TCCCGGTT组合基因型个体(P<0.05)。6.牛ANGPTL3基因的突变在郏县红牛、南阳牛和育肥牛的验证选择牛ANGPTL3基因编码区3个突变(104(A/T),509(A/G)和8661(T/C)(NC007301))为候选突变,3个突变位点与173头南阳牛与郏县红牛不同月龄生长性状的关联分析结果表明:104(A/T)位点的A等位基因与体重(0、24月龄)和坐骨端宽(6、12、18月龄)显著相关(P<0.05);509(A/G)位点A等位基因与坐骨端宽(6、12、18、24月龄)极显著相关(P<0.01);AAAGTT组合型个体的坐骨端宽(6、12、24月龄)、体重(24月龄)和日增重(24月龄)指标上显著高于AAAATT组合型个体。104(A/T)位点的AT基因型与胴体嫩度极显著相关(P<0.01);509(A/G)位点的AG基因型与胴体嫩度和眼肌面积极显著相关(P<0.01)。ATAGTT基因组合型个体的胴体嫩度指标极显著的大于AAAATT基因组合型个体(P<0.01),显著大于TTAATT基因组合型个体(P<0.05)。ATAGTT基因组合型个体在胴体眼肌面积指标上显著大于AAAATT基因组合(P<0.05)。
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