【摘 要】
:
绒山羊作为重要的经济动物之一,以生产优质羊绒而著称,如何提高羊绒产量和绒毛品质一直以来备受研究者和生产者的关注。毛囊发育的周期变化直接影响羊绒产量和绒毛品质,这一过程受到多种基因和信号通路的共同调控,表观遗传修饰在协调体内基因表达情况,响应环境变化中发挥着至关重要的作用。在多种表观遗传修饰的研究中,有关组蛋白修饰对毛囊周期变化的影响多见于小鼠上,在绒山羊皮肤毛囊发育中的研究未见报道。H3K27me
【基金项目】
:
国家自然科学基金(编号:31501990);
论文部分内容阅读
绒山羊作为重要的经济动物之一,以生产优质羊绒而著称,如何提高羊绒产量和绒毛品质一直以来备受研究者和生产者的关注。毛囊发育的周期变化直接影响羊绒产量和绒毛品质,这一过程受到多种基因和信号通路的共同调控,表观遗传修饰在协调体内基因表达情况,响应环境变化中发挥着至关重要的作用。在多种表观遗传修饰的研究中,有关组蛋白修饰对毛囊周期变化的影响多见于小鼠上,在绒山羊皮肤毛囊发育中的研究未见报道。H3K27me3作为重要的组蛋白修饰之一,对维持哺乳动物毛囊正常发育具有重要调控作用,因此,本研究主要探究H3K27me3对绒山羊毛囊周期再生调控的分子机制,以期为绒山羊绒毛提质增效提供理论依据。本研究选用3只成年陕北白绒山羊作为研究对象,分别采集其在生长期、退行期和休止期的皮肤组织样,利用染色质免疫共沉淀——测序技术(chromatin immunoprecipitation followed by sequencing,ChIP-seq)分析H3K27me3在不同时期对功能基因的修饰情况,通过筛选差异结合位点并进行功能注释和通路富集分析,进一步探究H3K27me3在毛囊再生周期中的调控作用;利用RNA-seq技术分析不同时期基因在转录水平上的差异;联合分析ChIP-seq和RNA-seq数据,筛选受H3K27me3直接作用的潜在靶基因,分析H3K27me3对毛囊发育相关基因的调控机制。主要试验结果如下:1.ChIP-seq分析结果表明,H3K27me3主要富集在基因的TSS区域,在陕北白绒山羊毛囊周期发育过程中存在动态修饰作用,生长期表现出高甲基化状态,退行期表现出低甲基化状态,休止期的甲基化状态介于生长期和退行期;对差异结合位点进行分析并对位于promoter区的peaks进行基因注释,结果发现生长期和退行期间共有7946个差异修饰基因(differentially modified genes,DMGs),生长期与休止期间有2419个DMGs,休止期与退行期间有397个DMGs。GO和KEGG富集分析表明,这些DMGs能够参与细胞、生物调控、发育和代谢等过程以及刺激响应,并参与MAPK、Hippo、Rap1和Focal adhesion等多条与毛囊周期发育相关的信号通路。2.RNA-seq分析结果表明,陕北白绒山羊毛囊不同发育时期共有1301个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中,生长期和退行期间有1147个DEGs,生长期和休止期间有61个DEGs,休止期和退行期间有178个DEGs。GO和KEGG功能注释分析结果表明,这些DEGs同样也参与响应刺激、生物调控、发育和代谢等过程,以及PI3K-Akt、Wnt、AMPK和Rap1信号通路以及Focal adhesion等与毛囊周期发育相关通路,发现了潜在参与绒山羊毛囊周期发育的关键基因,包括SOX9、LHX2、LGR5、DBP、NR1D1、SOCS3和NR4A1等。3.ChIP-seq和RNA-seq联合分析共获得550个受H3K27me3直接调控的潜在靶基因,主要为生长期和退行期间差异表达的基因。相对于退行期,组蛋白高甲基化修饰主要发生在生长期,受到修饰的DEGs有273个在生长期低表达,274个在生长期高表达,低表达的DEGs中的高差异基因COL1A1、NR4A1、SOCS3、ETS1以及SERPINE1与细胞凋亡有关,这些基因更利于生长期毛囊的再生和退行期毛囊细胞稳态的维持。生长期高表达的基因KRT17、SOX9、LGR5、LHX2、DBP和NR1D1与细胞增殖和毛囊周期发育有关,通过预测H3K27me3结合位点的转录因子结合基序,发现H3K27me3可能通过影响Sp/KLF家族抑制因子在靶基因上的结合而影响基因的表达。综上所述,陕北白绒山羊毛囊的周期性发育与H3K27me3对毛囊发育相关基因的动态修饰作用有关,表现在生长期H3K27me3高修饰,退行期低修饰,休止期H3K27me3修饰作用逐渐上升,这一特点对维持绒山羊毛囊在整个发育周期的有序变化至关重要。本研究结果为深入探究绒山羊毛囊生长发育的调控机制提供了新思路,为改善绒山羊绒毛品质提供科学依据。
其他文献
妊娠早期是奶牛妊娠建立和维持的关键时期,此阶段奶牛生理状态发生巨大变化,如生殖器官性能、内分泌调节、活动量以及发情状况等均会发货所能改变。阐明妊娠早期奶牛生理参数变化情况,从而全面了解奶牛妊娠早期这一生理阶段,可提高奶牛早期妊娠诊断准确率。乳外泌体miRNA可反映机体的生理状态,参与到奶牛广泛的生殖活动中,是良好的生物标志物,其变化可作为预测奶牛是否妊娠的重要依据。目前关于奶牛妊娠过程中外泌体mi
哺乳动物的精子产生于睾丸,但却是在附睾管腔微环境相关因子的作用下成熟。在这一过程中,附睾蛋白扮演着重要角色。附睾关键蛋白分泌紊乱会导致精子成熟异常,进而导致雄性不育,因此,理解附睾特异蛋白的功能有助于治疗雄性不育。之前的研究表明,GLB1L4(Beta-Galactosidase-1 Like 4,GLB1L4)蛋白在大鼠附睾头部主细胞特异性表达,其能被分泌到附睾管腔中,当附睾发育完成,精子进入附
牛奶因其丰富的营养成分而被称为满足人类营养需求的“全价食物”,而乳脂不仅仅是牛奶的主要能量成分,更决定了乳制品的物理特性,制造特性及感官品质。因此,如何提升乳脂率一直是国内外乳制品产业亟待解决的科学问题,而从分子生物学角度出发研究调控乳脂肪形成的基因网络也已成为该领域的研究热点。越来越多的研究表明,在乳腺上皮细胞中,miRNA可抑制其靶标mRNA的表达,并通过相应的靶基因参与到下游信号的传导途径从
鸡胚性腺的发育具有二态性,即雌雄鸡胚性腺发育不相同,雄性鸡胚双侧性腺发育为睾丸,而雌性鸡胚性腺右侧发生退化,左侧性腺发育为卵巢。这一生物过程是由许多生物因子共同作用的结果,但其具体机制还未见报道。miR-199a是具有调控细胞增殖凋亡作用的miRNA,然而有关gga-miR-199a是否在鸡胚性腺发育中起作用的研究并不多,主要是由于可用于体外研究基因功能的鸡细胞系较少,且鸡细胞培养对温度和血清的要
视网膜血管分割对糖尿病视网膜病变、高血压、心血管和脑血管等疾病的诊断有重要的研究价值和意义。糖尿病可以诱发许多并发症,其中眼部并发症有糖尿病性视网膜病变、白内障,青光眼等,它们的致盲是有不可逆转的。眼底作为人体能够直接观察到血管的部位,其自身的变化,如血管宽度、角度、分支形态和有无再生血管等,为眼科疾病的前期诊断提供了依据。目前诊断眼底疾病的主要方式是眼底血管分析,眼底血管分割则是疾病诊断分析的必
有机微量元素生物利用率高,使用低水平的有机微量元素替代无机微量元素能够在保证正常生产性能、健康的情况下,减少环境中的微量元素的排放。但是,目前已有研究中低水平有机微量元素替代无机微量元素的效果不一致。因此,本研究的目的是在泌乳奶山羊日粮中应用无机微量元素50%添加水平的有机微量元素替代方案,通过对奶山羊的泌乳性能、血液和乳中微量元素状态、抗氧化性能、消化代谢、瘤胃发酵功能等进行评价,为有机微量元素
硬蜱能够携带和传播广泛的病原体(细菌、病毒和原生动物),这些病原体对全球人类和动物的健康都有很大的威胁。关于蜱虫分布及其携带病原体方面的研究还相对较少。因此,本研究旨在掌握和完善陕西省硬蜱的种类及其携带病原情况,为进一步完善相应的蜱媒疾病的防控和深入研究提供数据支撑。2017年3月至2020年9月,收集陕西省西安市、咸阳市、安康市和汉中市共4个地区分别来自刺猬、犬和牛等动物体表的蜱。通过对蜱采用形
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)易引起奶牛慢性和隐性的乳腺内感染(Intramammary Infections,IMI),其生物被膜(biofilm,BF)的形成能力是推动IMI发生发展的关键因素,BF是一种可以在生物和非生物的表面形成的有组织的、复杂的和固着的结构性细菌群落,BF的形成能够使S.aureus在恶劣环境中生存并持久存在。近年来,由于临
松鼠葡萄球菌作为机会性致病菌能造成多种感染和疾病,并且近年来在家畜生产全过程以及临床的检出率逐渐上升。抗生素在畜牧业中的不合理使用,造成的抗生素筛选压力刺激诱导松鼠葡萄球菌抗生素耐药性产生和扩散,使得家畜细菌感染难以治愈,影响畜牧产品质量。并因此,阐明畜牧源松鼠葡萄球菌的抗生素耐药性的产生,并通过分子生物学和基因组学方法揭示其遗传机制,对于促进畜牧业发展具有积极意义。绝大多数松鼠葡萄球菌含有mec
子宫内膜炎是导致母畜流产、屡配不孕的重要原因,严重影响母畜的繁殖率和生产性能。子宫内膜炎的致病微生物和其致病因子,是导致子宫组织损伤、引起子宫内膜炎的主要原因。大肠杆菌、芽孢杆菌、化脓隐秘杆菌、链球菌、葡萄球菌等是导致子宫产后感染主要致病菌,脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)是子宫内膜炎致病菌大肠杆菌的致病因子,能够引起子宫内膜的炎症。尽管LPS引起的炎症反应已有诸多报道,但是