基于miRNA-mRNA表达谱分析探讨2,5-己二酮致卵巢颗粒细胞周期阻滞的调控机制

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bupingzhenren
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
正己烷(n-Hexane)是一种具有蓄积毒性的常用工业有机溶剂,由于其职业暴露人群众多且呈女性化、年轻化的特点,正己烷及其主要毒性代谢产物2,5-己二酮(2,5-HD)对女性健康的影响特别是生殖健康的影响日益受到关注。目前国内外研究表明,正己烷及2,5-HD可导致女(雌)性生殖功能损害,干扰卵巢颗粒细胞的生存与凋亡进而损害卵巢可能是其重要毒性机制之一。细胞凋亡涉及非常复杂的调控机制,其中细胞周期的进展是决定细胞增殖或凋亡的重要条件。调节细胞周期正常进程的基因表达异常则会导致细胞周期紊乱。miRNA作为重要的表观遗传调控方式之一,可在转录后水平调控基因的表达进而调节细胞功能,包括调节细胞周期。另外,有研究表明在颗粒细胞的发育及功能中miRNA调控发挥关键作用。因此,本研究通过体外染毒模型,结合miRNA和mRNA芯片技术,从转录后水平探讨miRNA参与调控的关键信号通路在2,5-HD致卵巢颗粒细胞周期阻滞中的作用,旨在从系统性的角度初步分析miRNA介导的表观遗传学调控是否参与其中,以及可能的关键靶点,为进一步揭示正己烷的卵巢毒性机制提供实验依据。同时,为探索正己烷的卵巢毒性干预靶点提供新的思路,这对于制定合理有效的职业卫生防治措施,保护正己烷职业暴露女工的生殖健康具有重要的现实意义。第一部分卵巢颗粒细胞2,5-HD体外染毒后mRNA和miRNA表达谱分析目的:通过对2,5-HD染毒后miRNA和mRNA表达谱进行生物信息学分析,从转录后水平探讨2,5-HD致卵巢颗粒细胞毒性损伤过程中miRNA可能的调控作用,进一步寻找其可能介导的关键生物学效应及信号通路。方法:1、21日龄雌性SD大鼠,双侧卵巢提取原代颗粒细胞培养,2,5-HD(0 mmol/L、60 mmol/L)染毒24 h。应用miRNA和mRNA芯片技术,比较分析两组细胞的miRNA和mRNA表达谱,筛选出差异表达的miRNA和mRNA;2、利用在线数据库预测差异表达miRNA的靶基因,构建miRNA-mRNA共表达关系网络,并进一步将共表达网络中的靶mRNA进行功能富集分析,包括GO分析和KEGG分析;3、筛选与细胞周期和Wnt通路相关的miRNA,从中挑选7个miRNA,大鼠卵巢颗粒细胞2,5-HD(0mmol/L、20mmol/L、40mmol/L、60mmol/L)染毒24h,RT-PCR检测其表达情况,验证miRNA芯片结果。结果:1、根据(Fold Change≥2,P≤0.05)的标准,本次芯片分析共获得5678个差异表达的mRNAs,其中2982个上调,2696个下调;32个差异表达的miRNAs,其中13个上调,19个下调;2、miRNA-mRNA共表达分析1)利用miRWalk、miRanda、Target Scan三个数据库分别预测DEMs的靶基因与DEGs取交集,并筛选与对应miRNA呈负相关关系的mRNA。三个数据库的结果取交集后共获得纳入网络的靶mRNA 262个,与27个miRNA形成368对miRNA-mRNA共表达关系对,并进行可视化。2)GO分析-生物学过程分析结果提示,共表达网络中靶mRNA富集到的排名前20的GO条目中,有3条与细胞周期相关(GO0006977、GO0007050、GO0051726),2条与经典Wnt通路相关(GO0090090、GO0060070);3)KEGG分析结果显示,共表达网络中靶mRNA显著富集到46条信号通路,按照-log(P-Value)的值排序得到前30个通路,Wnt信号通路(Wnt signaling pathway)排在第10位,细胞周期通路(Cell cycle)排在第23位;3、从15个可能参与调控细胞周期和Wnt信号通路的miRNA中挑选7个miRNA进行RT-PCR验证,结果显示,与对照组相比,各剂量组rno-miR-3473的表达水平均上升(P<0.05),各剂量组rno-miR-214-3p、rno-miR-138-5p和rno-miR-199a-3p的相对表达量降低(P<0.05),40mmol/L、60mmol/L剂量组的rno-miR-145-5p和rno-miR-143-3p相对表达量降低(P<0.01),而各剂量组rno-miR-196a-5p的相对表达量没有明显变化。PCR的结果与miRNA芯片的结果基本一致。第二部分Wnt/β-catenin通路在2,5-HD致卵巢颗粒细胞周期阻滞中的作用及可能机制目的:利用体外染毒实验,研究2,5-HD对大鼠卵巢颗粒细胞周期的影响,并进一步探讨Wnt/β-catenin通路在其中的作用及可能机制。方法:1、2,5-HD(0mmol/L、20mmol/L、40mmol/L、60mmol/L)染毒颗粒细胞24 h后,检测颗粒细胞周期分布情况,以及细胞周期相关基因mRNA的表达水平;2、2,5-HD(0mmol/L、20mmol/L、40mmol/L、60mmol/L)染毒颗粒细胞24 h后,检测Wnt/β-catenin信号通路相关基因mRNA和蛋白的表达水平;3、2,5-HD(0 mmol/L、10 mmol/L、20mmol/L)染毒人卵巢颗粒瘤细胞6 h后,双荧光素酶报告基因检测β-catenin入核介导的转录活性。结果:1、流式细胞术结果显示,2,5-HD染毒卵巢颗粒细胞24 h后,与对照组相比,各剂量组G0/G1期细胞比例均升高(P<0.05),各剂量组S期细胞比例均下降(P<0.05),G2/M期细胞比例在40mmol/L和60mmol/L剂量组发生下降(P<0.05);2、RT-PCR结果显示,2,5-HD染毒24 h后,与细胞周期密切相关的P21、Cdk2、Ccnd1基因mRNA表达均发生显著改变:与对照组相比,各剂量组P21 mRNA相对表达量升高(P<0.05);各剂量组Cdk2 mRNA相对表达量随着染毒剂量的升高而下降(P<0.05),各剂量组Ccnd1 mRNA相对表达量呈剂量依赖性下降(P<0.01);3、Wnt/β-catenin信号通路相关基因mRNA和蛋白的表达情况1)RT-PCR结果显示,2,5-HD染毒24 h后,与Wnt/β-catenin信号通路相关的8个基因mRNA表达均发生变化:与对照组比较,各剂量组Fzd1、Lrp6、Tcf3、Tcf4这4个基因的mRNA相对表达量随着染毒剂量的升高而降低(P<0.001),40mmol/L、60mmol/L剂量组中Fzd6、Lrp5、β-catenin、Lef1这4个基因mRNA相对表达量均降低(P<0.05);2)Western blot结果显示,2,5-HD染毒24 h后,与对照组相比,40mmol/L、60mmol/L剂量组中β-catenin蛋白表达水平下降(P<0.05),各剂量组中CCND1蛋白表达水平呈剂量依赖性下降(P<0.05);3)细胞免疫荧光实验结果显示,2,5-HD染毒24 h后,与对照组相比,各剂量组中β-catenin在颗粒细胞核内的荧光表达强度均降低(P<0.05),提示2,5-HD可抑制β-catenin核转位;4、2,5-HD染毒COV434细胞6h后,双荧光素报告基因检测的结果显示,与对照组相比,TOP/FOP的比值随着染毒剂量的升高而显著下降,即荧光素酶活性显著下降(P<0.05),提示2,5-HD可导致β-catenin/TCF转录活性降低。结论:在本实验条件下,本研究得出以下结论:1、2,5-HD染毒后大鼠卵巢颗粒细胞miRNA和mRNA表达谱发生变化,提示2,5-HD致卵巢颗粒细胞损伤过程中,miRNA等表观遗传学调控机制可能参与其中。2、对miRNA-mRNA共表达网络中mRNA进行功能富集分析结果提示,2,5-HD染毒后可能通过miRNA介导卵巢颗粒细胞细胞周期和经典Wnt信号通路调控。3、2,5-HD体外染毒可导致卵巢颗粒细胞细胞周期阻滞于G0/G1期。4、2,5-HD可能通过诱导卵巢颗粒细胞Wnt/β-catenin通路抑制,抑制β-catenin的核转位,导致β-catenin/TCF转录活性降低,降低了该通路的代表靶点CCND1等基因的表达,进而诱导细胞周期阻滞在G0/G1期。
其他文献
利用IPCC经典碳排放计算理论, 基于农资投入、农田利用及畜禽养殖3类主要碳源, 测算了山东省2000—2020年农业碳排放量, 采用LMDI模型开展影响因素分析, 并运用灰色预测模型GM(1, 1)预测2020—2045年碳排放量。结果表明: 2020年山东省农业碳排放量为1.58×107 t, 农业碳排放强度0.205 t·(104¥)-1。2000—2020年山东省农业碳排放总量呈先上升后波
作为一个新兴的资本市场,我国资本市场发展时间短,发展势头迅速,有极大的发展潜能。然而,目前我国上市公司信息披露及财务审计制度还很不完善,存在着诸多上市公司财务舞弊行为。根据证监会通报数据显示,2020年将重点打击财务舞弊案件,全年共进行财务舞弊立案33起。而其中,作为央企,a股上市公司航天通信控股的子公司智慧海派在开年不久就因为涉嫌财务舞弊而被证监会立案调查,引起了投资者极大关注。为增厚利润,寻找
目的:探索患者SUFU(rs17114808)单个核苷酸多态性位点(SNP)的不同基因型对地中海贫血患儿异基因造血干细胞移植后GVHD(Graft-versus-host Disease,移植物抗宿主病)的影响。方法:对2018年10月至2020年11月在厦门大学附属中山医院血液科进行异基因造血干细胞移植的44例地中海贫血患儿进行基因型检测,在预处理前采集外周血标本,送检提取外周血基因组DNA,采
目的分析本院高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent Klebsiella pneumoniae,hvKP)的检出情况、耐药性、黏液表型、毒力基因型、荚膜血清型以及多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)等,为本院hvKP感染的防控及精准诊疗提供依据;利用蛋白组学探索可区分hvKP与经典肺炎克雷伯菌(classic Klebsiella pneumon
目的:通过回顾性分析288例因宫颈高级别鳞状上皮内病变(high-grade squamous intraepithelial lesion,HSIL)住院行宫颈冷刀锥切术(cold knife conization,CKC)治疗患者的临床资料及术后随访情况,了解本院HSIL患者基本特征,探讨影响手术切缘状态的因素,并分析其中220例单纯行CKC患者术后复发的危险因素。检测宫颈病变中自噬相关基因(
近年来,印尼政府对汉语教学管制的放松,使得汉语教学在印尼得到了一定的发展,2019年印度尼西亚西努沙登加拉省开展“千人计划”的来华留学项目,计划五年内向中国派送千名留学生来华留学,当地对于汉语教师的需求不断增加。本人作为被派往西努沙登加拉省龙目岛真理基督学校的首批志愿者,在教学过程中不可避免地遇到了许多跨文化交际问题。案例分析是研究跨文化交际问题的一种行之有效的方法,本文呈现了笔者在真理基督学校任
背景:鉴别两种不同处理条件下或者不同表型之间的差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)是高通量基因表达谱分析的基本任务。先前我们实验室开发了基于样本内相对表达秩序关系(REOs)的Rank Comp算法,能够用于群体和个体水平差异表达基因的识别,具有对批次效应不敏感等优点。Rank Comp算法中采用Fisher精确检验对列联表进行显著性水平计算,评价
目的观察右美托咪定(Dexmedetomidine,DEX)对高糖诱导SH-SY5Y/APP695(Swedish mutant APP transfected SH-SYSY,SAS)细胞损伤的保护作用并探究其机制。方法1建立SAS细胞高糖损伤模型:通过对SAS细胞不同时间和不同糖浓度培养,采用CCK-8法测定细胞活性,选取适宜浓度和处理时间,建立高糖损伤模型。利用不同浓度DEX处理高糖损伤SA
目的1、研究成人患者使用替考拉宁(Teicoplanin)血药谷浓度(Minimum Concentration,Cmin)与疗效和安全性的相关性,摸索替考拉宁治疗的最佳安全有效血药浓度范围,并探讨影响替考拉宁血药谷浓度与临床疗效的因素,为临床合理用药提供参考。2、运用人工神经网络(Artificial neural network,ANN)法构建替考拉宁血药浓度的预测模型,评价模型的应用效果和特
目的:通过回顾性分析单中心瘙痒性皮肤病患者的临床病例资料,分析各临床资料与瘙痒视觉模拟评分(VAS)间的相关性。检测B型钠尿肽(BNP)及其受体NPR1、NPR2在正常皮肤及瘙痒性皮肤病患者皮损中的表达情况,探讨BNP在瘙痒性皮肤病中的作用。方法:采用回顾性分析,纳入2016年2月至2021年2月间福建医科大学附属第一医院皮肤科住院部确诊的110例特应性皮炎(AD)患者、118例慢性湿疹(CE)患