北极海水中可培养细菌多样性研究及可培养细菌的分离鉴定

来源 :华中师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenzi004
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北极由于其独特的地理位置,使得北极有其独特的生态环境,如北极具有极昼极夜现象,气候异常寒冷,冰封时间长,以及强辐射等。现已经成为了各国科学家研究的热点地区,极地微生物因不同于其它地区的微生物,也成为科学家研究的热门领域。本文的研究内容主要是初步分析北极海洋可培养细菌的多样性,回顾以往科学家对北极海洋微生物的研究主要集中在对北极海冰,北极海洋沉积物的细菌多样性研究,但是对北极地区海水中的可培养细菌的多样性研究的比较少。本研究通过模拟北极海水细菌的低温生存环境,对北极海水中的可培养细菌富集培养,然后构建16SrDNA序列克隆文库,应用分子生物学方法对北极海水中的可培养细菌进行多样性分析,分析可培养细菌间系统进化关系,了解北极不同地区,不同深度海水中可培养细菌的类群的差异。丰富了北极海洋细菌16SrDNA数据库,为了解北极海水可培养细菌多样性提供分子生物学的基础数据,同时也为开发利用北极海洋微生物提供了一定的理论基础。本文通过构建细菌16SrDNA文库,对北极海水不同深度,不同地区的五个站点(B80-40M站点,B80-3.5km站点,B79-100m站点,C19站点,B84A-30m站点)中的可培养细菌的多样性研究,结果表明北极海水中可培养细菌多样性丰富,不同站点均有还不能确定分类地位菌群存在,例如在B80-40m站点中有超过60%的克隆子不能确定其分类地位,说明北极海水中存在巨大的微生物资源。系统进化树表明,五个站点中可以确定分类地位的细菌主要属于α-变形菌纲,γ-变形菌纲和拟杆菌门三个门类,其中a变形菌纲属于优势种群,其次分别为r变形菌纲和拟杆菌门。五个站点可以确定分类地位的细菌分别属于以下15个属:Hyphomonas, Roseobacter, Parvularculaceae, Alpha proteobacterium, Metlycophaga, Gamme proteobacter, Flexibacter, Marinomonas, Pseudomonas, Brevundimonas, Sphingomonas, Providencia, Alcaligenes, Vibrio, Zobelia。采用平板划线分离的方法,从北极样品中依次传代纯化分离出单菌落。初步分离鉴定101株细菌,测序分析结果显示,这101株菌分属于α-变形菌纲,γ-变形菌纲和拟杆菌门三个大类,这与前面分析的北极站点可培养细菌的多样性分析的结果是一致的。可进一步细分为以下10个属:Glaciecola、Roseobacte、Halomonas、 Rhodococcus、Kocuria、Brevundimonas、Psychrobacter、Pseudorhodobacter、 Sphingomonas、Flexibacter。
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