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荔枝起源于中国，种质资源丰富，是华南著名的特产果树和经济果树，但相对于其他果树，荔枝的遗传育种还比较落后。本研究在前人研究的基础上，通过增加AFLP标记和SRAP标记的方式，继续构建荔枝的分子遗传图谱。获得的主要结果如下：
1运用改良CTAB小量法对焦核三月红、马贵荔2个亲本及其杂种群体，共计85份荔枝材料获得了高质量的基因组DNA，通过所得的基因组DNA进行AFLP、SRAP体系分析，均获得了清晰的条带。
2运用RAPD分子标记，对“马贵荔×焦核三月红”杂种群体进行杂种鉴定，获得80株真杂种。
3以“马贵荔×焦核三月红”F1代群体的60个单株为作图群体，筛选出扩增稳定、多态性丰富的27对SRAP引物、36对AFLP引物，对大群体进行分子标记分析，共获得母本特有位点405个，父本特有位点371个，双亲共有位点250个，经x2检验，共有322个位点偏离孟德尔分离，比例为32.8％。本研究结合刘成明和刘睿获得的334个RAPD多态性标记，采用JoinMapgR3.0软件进行连锁分析，得到马贵荔和焦核三月红的分子遗传图谱。构建的马贵荔分子遗传图谱含147个标记，形成22个连锁群，覆盖总图距964.7cM，位点之间的平均遗传距离为6.6cM：焦核三月红的分子遗传图谱包含371个标记，形成18个连锁群，覆盖总图距730.4cM，位点之间的平均遗传距离为4.1cM。本研究首次将AFLP技术和SRAP技术应用到荔枝的遗传图谱的构建中，总体上，获得了高密度的遗传图谱，为开展荔枝的QTL，定位分析和重要性状基因定位奠定基础。