miR-135b-5p在口腔鳞状细胞癌中的表达及相关生物信息学分析

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目的:既往研究表明,mi R-135b-5p在多种恶性肿瘤中异常表达且参与肿瘤的发生发展。目前mi R-135b-5p在OSCC中的表达情况存在争议,其临床意义缺乏文献支持。本研究旨在明确mi R-135b-5p在OSCC患者癌和癌旁组织中的表达情况和临床意义;初步预测mi R-135b-5p靶基因并进行相关生物信息学分析,为寻找OSCC患者诊断和靶向治疗的分子标志物提供理论依据。方法:(1)通过TCGA、GEO数据库数据分析OSCC患者癌和癌旁组织中mi R-135b-5p的表达情况,分析mi R-135b-5p的表达与患者临床病理特征的关系;(2)临床收集OSCC患者癌组织和正常组织标本各30例,采用q RT-PCR进一步验证mi R-135b-5p的表达情况;(3)依据mi R-135b-5p的表达情况绘制ROC曲线,计算曲线下面积,评价mi R-135b-5p作为诊断指标的准确性;(4)从mi RTar Base、Target Scan和mi RDB三个数据库预测mi R-135b-5p的靶基因,选取至少两个数据库中共同预测到的基因与TCGA数据库下载分析的差异m RNA取交集,获得最终预测靶基因;(5)将最终得到的预测靶基因进行GO分析和KEGG信号通路富集分析;(6)通过STRING数据库构建蛋白互作网络并筛选中枢靶基因。结果:(1)TCGA、GEO、q RT-PCR分析结果显示mi R-135b-5p在OSCC组织中高表达(P<0.001);(2)mi R-135b-5p表达水平与组织病理分级相关(P=0.011);(3)mi R-135b-5p表达量对OSCC患者具有良好的诊断效能(AUC=0.960,P<0.001);(4)GO分析结果提示:在生物过程中,靶基因主要参与了钠离子转运调节、突触前胞质钙离子浓度的调节。在分子功能中,靶基因主要参与了环核苷酸磷酸二酯酶活性、跨膜转运离子蛋白活性的调控。细胞成分里,靶基因主要在突触膜、离子通道复合体等部位发挥作用;(5)KEGG通路富集分析结果提示:mi R-135b-5p的靶基因富集集中在与肿瘤相关的钙离子信号通路、c GMP-PKG信号通路、c AMP信号通路和PI3K-Akt信号通路中;(6)PPI网络分析确定了10个在蛋白相互作用中处于核心位置的中枢靶基因:DLG2、ANK3、ERBB4、SCN2B、NBEA、GABRB2、ATP2B2、CACNA1D、SNTA1、SPTBN4结论:(1)mi R-135b-5p在OSCC中高表达且与肿瘤组织病理分级有关,可作为一种促癌因子参与口腔鳞状细胞癌的发生发展。(2)初步预测分析了mi R-135b-5p的靶基因及其功能,为进一步寻找OSCC患者诊断和靶向治疗的分子标志物提供了一定的理论依据。
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