色氨酸侧链作为P2’的基质金属蛋白酶抑制剂的研究

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基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproetinases,简称MMP)是一类含锌的金属蛋白水解酶,能够裂解细胞外基质。目前人类已经发现几十种MMP,在对它们的研究中发现:哺乳动物的MMP分为可溶型和膜型两种两类。可溶型MMP可以进一步划分为以下几组:胶原酶、明胶酶、基质溶解素、基质溶解因子和金属弹性蛋白酶;膜型MMP为Ⅰ型跨膜蛋白酶和Ⅱ型跨膜蛋白酶。MMP的表达活性失衡引发多种疾病,如多发性硬化症,老年痴呆,肺癌,肝癌,胰腺癌等。目前发现的近30种MMP中,只有MMP-1、MMP-2和MMP-7是治疗癌症的靶酶,开发MMP的选择性抑制剂(MMPI)至关重要。  对MMP的研究中发现,赝肽类基质金属蛋白酶抑制剂的结构一般包含俩部分:锌离子结合基团(ZBG)和侧链。其中侧链又分为P1侧链、P2侧链和P3侧链。P2对应MMP的S2口袋暴露在溶剂中,P2既要有溶剂化能力又要有疏水作用。亮氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、叔丁基甘氨酸等几乎包含P2侧链的赝肽类抑制剂。在这些抑制剂中使用的氨基酸与是否有有稠环体系和杂原子的疏水残基有关。这就表示P2侧链的选取点在平面稠环芳基和氢键。色氨酸的吲哚基既满足平面稠环芳基又满足氢键这两点,所以本文以2-异丁基-3-硝基丙酰色氨酸酰胺为基本骨架,选择硝基作锌离子结合基团,设计并合成了一系列色氨酸衍生物,探讨它们对MMP-1、MMP-2和MMP-7的选择性抑制能力。  本文设计并合成了一系列2-异丁基-3-硝基丙酰色氨酸酰胺化合物。目标化合物(13a-13d)与MMP-1、MMP-2和MMP-7进行动力学测试。其的Ki值分别为27.6μM、30.0μM、53.2μM、34.9μM;17.0μM、26.3μM、24.9μM、13.5μM;26.1μM、16.4μM、19.8μM、22.7μM。测试结果表明:当P2选择色氨酸侧链,化合物(13a-13d)对MMP-1、MMP-2和MMP-7的选择性抑制效果较差。  本研究表明,P2为色氨酸侧链时,无法实现对MMP的选择性抑制。结合实验室前期工作,MMP的S1口袋和S3口袋是实现选择性抑制的首选。
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