猪伪狂犬病病毒FZ株UL17基因的克隆、序列分析及原核表达载体的构建

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:lizq06
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猪伪狂犬病(Pseudorabies,PR)目前已成为对养猪业危害最大的疾病之一,给全球养猪业造成巨大的经济损失,尽管该病的根除计划在美国和欧洲已取得显著成效,但对大多数国家而言,这仍是一个非常严峻的问题。作为疱疹病毒生物学研究的良好模型之一,猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)已经受到越来越多的关注。PRV UL17基因全长1736bp,编码597个氨基酸,分子量为64kDa,其编码产物已被证实是病毒衣壳的组成成分之一,与病毒NDA的切割及包装有关。本研究从本实验室分离鉴定并保存的PRV FZ株中克隆到UL17基因,并构建了原核表达载体pET-UL17。根据GenBank中已发表的PRV UL17基因序列,设计一对特异性引物,以病毒DNA作为模板,通过PCR技术扩增UL17基因,将扩增片段克隆于pMD-18TSimple Vector进行测序。由于G+C含量太高,导致序列未能完全测通,已测出1736bp,未测通片段大小约60bp。应用DNAStar序列分析软件分析,结果表明,已成功克隆到UL17基因,且与已报道的Ea株及Ka株核苷酸序列同源性均在96%以上。用在线Conserved Domain Search工具进行保守功能区分析,发现UL17蛋白含有两个保守的功能域。氨基酸序列分析发现,其编码产物含有蛋白激酶C磷酸化位点和酪蛋白激酶2磷酸化位点,表明UL17蛋白质可能是磷酸化蛋白质。通过将UL17基因插入原核表达载体pET-32a(+),构建重组质粒pET-UL17,并成功转入大肠杆菌E.coli DH5_α,阳性克隆子通过PCR和酶切鉴定得以验证。密码子偏爱性分析结果表明,PRV UL17蛋白在同一氨基酸的不同密码子的选择上存在一定的偏爱性,主要偏爱使用富含GC特别是第三密码子位置上核苷酸是C或G的密码子。
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