【摘 要】
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背景:作为泌尿系统最常见肿瘤之一,膀胱癌具有较高的复发率和进展可能。此外,即使经过系统治疗,膀胱癌患者的预后仍不佳,尤其是对于已发展至肌层浸润的患者。筛选鉴定膀胱癌
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背景:作为泌尿系统最常见肿瘤之一,膀胱癌具有较高的复发率和进展可能。此外,即使经过系统治疗,膀胱癌患者的预后仍不佳,尤其是对于已发展至肌层浸润的患者。筛选鉴定膀胱癌肿瘤标志物及探究相关机制仍是当前膀胱癌研究的重点。目的:通过一系列生物信息学方法筛选更多更有效的膀胱癌生物标志物并探究膀胱癌相关潜在机制。方法:首先使用加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络及生存分析筛选与膀胱癌进展、预后均相关的潜在生物标志物。另外使用一系列生物信息学方法对候选生物标志物进行初步验证及分析。然后进一步探究COL5A1与膀胱癌相关临床特征关系,并使用生物信息方法对COL5A1影响膀胱癌进展及预后的机制进行探究。结果:通过加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析及生存分析,筛选得到与膀胱癌进展及预后均相关的6个可能生物标志物(COL3A1、FN1、COL5A1、FBN1、COL6A1及THBS2)。对这些枢纽基因进行初步验证,结果显示它们均与膀胱癌进展相关且能够用于区分肌层浸润性膀胱癌与非肌层浸润性膀胱癌。进一步验证显示COL5A1与膀胱癌进展及预后不良相关。另外COL5A1与膀胱癌一些临床特征相关,如病理分期、病理分级、肿瘤情况及淋巴转移。功能和通过富集分析显示细胞外机制、免疫相关生物过程及通路与COL5A1高表达组膀胱癌进展及预后不良相关。此外,我们还通过生物信息学方法筛选得到一些与COL5A1高表达组膀胱癌进展及预后不良相关的microRNAs。结论:本研究不仅筛选得到数个与膀胱癌进展及预后相关的生物标志物,而且还探究了膀胱癌相关潜在机制。作为新的发现,这些结果可能有助于了解膀胱癌相关机制,并为以后的研究提供线索。
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