目的:采用网络药理学及分子对接方法,揭示苏合香丸和安宫牛黄丸治疗脑卒中的作用机制。从分子层面阐明苏合香丸及安宫牛黄丸治疗脑卒中的“寒热证型”、“同病异治”、“异病同治”的分子机制,推测苏合香丸及安宫牛黄丸的适应证型,为研究和利用苏合香丸及安宫牛黄丸提供理论基础。方法:应用化学信息数据库及文献挖掘收集苏合香丸和安宫牛黄丸的成分;利用TCMSP或Swiss ADME平台进行口服利用度和类药性筛选获取潜在有效成分;Swiss Target Prediction平台预测有效成分的作用靶标,构建药物-成分-作用靶标网络。通过Gene Cards、OMIM、TTD平台获取脑卒中的疾病基因靶点,将药物靶标和疾病基因相交集获得共同靶点。利用STRING及Cytoscape 3.8.2软件构建靶标-疾病基因PPI网络,筛选关键靶点和核心基因团簇,借助Metascape平台对关键靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,并就筛选出来的核心有效成分及其作用靶标映射到通路中,构建核心有效成分-靶标-通路网络。筛选关联性高的核心有效成分与作用靶标利用Auto Dock 4.2进行分子对接,分析对接结果。结合文献阐述有效成分、作用靶标的功能,在网络药理学的水平上进行分子层面分析探讨苏合香丸和安宫牛黄丸的作用机制及差异分析,并对安宫牛黄丸进行临床观察及疗效分析评价。结果:安宫牛黄丸与苏合香丸治疗脑卒中作用机制的研究中发现,复方组成药物有差异有共同成分,安宫牛黄丸共筛选得到有效成分174个,苏合香丸214个,共同有效成分58个。筛选出核心靶标安宫牛黄丸30个,苏合香丸31个,共同作用靶标20个,主要作用靶标相似程度较高。GO功能及KEGG通路富集显示两个复方共同参与10个生物学过程、13个分子功能、14个细胞组分,共同调节癌症通路、糖尿病井发症AGE-RAGE信号通路、阿尔茨海默病、类风湿性关节炎、膀胱癌、癌症中的转录失调、钙信号通路、血清素能突触、Apelin信号通路、神经活性配体受体相互作用通路发挥治疗脑卒中的作用。分子对接结果均具有较好的结合活性。临床观察发现安宫牛黄丸对神经功能缺损修复疗效明显,且减少住院天数。结论:苏合香丸及安宫牛黄丸可能通过作用于类似的靶标及通路,达到抑制脑细胞凋亡过程、促进神经元的存活及修复、抑制相关炎症因子改善机体免疫、促进血管生成、脂类分解代谢的功效。结合临床观察文献数据,认为可将安宫牛黄丸用于各种证型急性期的脑卒中治疗,苏合香丸是否适用于各种证型的脑卒中治疗,但有待于进一步实验验证及临床观察。