人文社会科学期刊与科技期刊的论文评审相比,受人的主观因素影响较大,同行评议显得尤为重要。人文社会科学论文能否发表,涉及的不仅仅是论文本身的学术问题,更受到评审主体、评审制度等更深层次因素的影响。在以经济建设为中心的当今社会,对人文社会科学期刊论文评审的研究不仅需要管理学、科学学等“近亲”学科为其提供智力支持,而且需要经济学的研究视角。为了深入分析这些影响因素产生的原因,从新制度经济学的角度,挖掘评审程序各个环节的经济学机制,采用新制度经济学分析方法,从人的有限理性和机会主义倾向、委托代理关系和交易成本三个方面展开研究。指出入作为经济社会主体,都具有谋求自身利益最大化的倾向；投稿作者、期刊编辑与同行专家之间存在着委托代理关系,三者之间的信息不对称,导致了逆向选择和道德风险的产生；在论文的评审过程中,由于对专家的搜寻、维护存在交易成本,评审周期的长短也给作者带来了时间成本,这些都影响了论文的最优选择和学术资源的最优配置。为了科学、客观、公正地评审人文社会科学论文,采用新制度经济学、引文分析和信息可视化方法对构建同行专家的选择与监督、信息沟通与反馈等机制进行了探讨。在同行专家遴选问题上,引入科学计量学方法可以降低人为因素干扰,减少逆向选择的产生；加强委托代理双方的沟通可以降低同行专家的道德风险,专家库的建立还可以增加交易频率、减少交易成本；主编的职责归位和开放同行评审可以对同行专家进行有效的监督。人文社会科学期刊需要通过制度建设来最大限度地屏蔽人情关系,从机制上解决问题。