论文部分内容阅读
目的:探讨新的环境应答基因—JWA和碱基切除修复(baseexcisionrepair,BER)基因—XRCC1单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)与中国南方汉族人群膀胱癌易感性的关系,结合对人群暴露环境危险因素情况分析进一步探讨环境-基因交互作用对膀胱癌发生的影响;对筛选出的JWA基因启动子部位的多态性位点进一步探讨其对转录活性的影响。
方法:选择经江苏省人民医院2003年1月-2004年12月间手术和组织病理学确诊的155例膀胱癌病例,按性别、年龄和出生地相匹配原则从参加健康体检的人群中选择155例作为对照组成155对病例-对照人群组。应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphism,PCR-SSCP)筛选JWA启动子和外显子区是否存在基因多态性位点、对发现的可疑位点进行DNA测序验证,对验证的DNA多态性位点进一步用PCR-限制性片段长度多态性(restrictionfragmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)方法检测全部病例和对照人群的基因多态性类型和分布;应用PCR-RFLP方法检测XRCC1基因多态性位点;对检测到的JWA基因启动子区域的多态性位点,构建含该多态性位点片段的氯霉素乙酰转移酶报告基因(reportergene)重组质粒,瞬时转染NIH-3T3细胞后,用CAT-ELISA方法检测JWA基因启动子多态性对该片段转录活性的影响,分别应用TRANSFACdatabase6.0软件和southwestern实验分析、检测影响其转录活性的顺式作用元件。
结果:(1)检测JWA基因启动子区域存在一SNP位点-76G→C;含有C等位基因和GC基因型频率的人群在膀胱癌病例组分别为7.40%、14.80%,明显高于对照人群组(2.90%、5.80%),差异有统计学意义(P<0.01,OR=2.71)。(2)在JWA基因第三外显子存在一SNP位点,即723T→G;含有G等位基因和TG+GG基因型频率的人群在膀胱癌病例组分别为37.10%、57.40%,明显高于对照人群组(21.29%、36.77%),差异有统计学意义(P<0.01,OR=2.13)。
(3)结果显示,XRCC1基因27466G→A的GA+AA和28152G→A的GA+AA基因型频率在膀胱癌病例组分别为42.6%,30.4%,与正常对照组(20.0%、70.3%)相比,差异有统计学意义(P值均<0.001,调整后OR分别为2.92、0.42);XRCC126304C→T的CT+TT基因型频率在膀胱癌病例组为56.8%、与正常对照组(50.3%)相比,差异无统计学意义(P值为0.36,调整后OR为1.34)。
(4)CAT-ELISA结果显示:与GG基因型相比,含有JWAGC基因型启动子片段的基础转录活性显著降低(P<0.01),多因素Logistic回归分析结果(P<0.05,OR=2.83)显示这一多态性可能是形成膀胱癌新的独立危险因素之一。
(5)进一步经环境—基因交互作用分析显示,JWA基因两个位点的多态性变异与吸烟、饮酒因素之间没有交互作用(均为P>0.05)。
(6)经TRANSFACdatabase6.0软件分析和Southwestern实验目前还没有检测到影响JWA转录活性的顺式作用元件或转录因子。
结论:(1)JWA723T→G、-76G→C和XRCC127466G→A变异位点均与中国南方汉族人群患膀胱癌危险性有关。
(2)XRCC128152G→A变异位点与中国南方汉族人群患膀胱癌的危险性呈负相关。
(3)JWA基因启动子-76G→C多态性变异可能影响JWA基因转录和表达。