改革开放以来，随着城市化和工业化的进程的加速，诸如国土空间无序开发、环境污染和生态破坏严重、区域经济发展不平衡等问题逐渐凸显，这与科学发展观的目标背道而驰。针对这些问题，国家“十一五”规划中明确提出要在全国范围内开展主体功能区划，以规范空间开发秩序，优化资源配置，促进区域经济协调发展，这是落实科学发展观的具体体现，有利于转变经济增长方式、促进人与自然和谐发展。为了更好地编制主体功能区划规划，国务院要求在全国选择部分典型省区开展省级主体功能区划分标准和方法等研究，并提出以RS、GIS等作为技术支撑体系，重庆被确定为八个试点省份之一。南川区在重庆市主体功能区划中属于都市发展新区，处于都市功能拓展区与渝东南生态保护区的“结合部”，是全市未来工业化城镇化主战场，南川区域经济协调发展对于推进重庆市主体功能区划的实施意义重大。本文选择南川区作为县域主体功能区划的研究对象，试图为南川区区域经济协调发展提供参考依据。本文在对国内外关于主体功能区划理论、方法进行分析总结的基础上，考虑研究区的实际情况，综合运用GIS技术、多因素综合评价法对南川进行了主体功能区划，拟将南川区划分为生态农业区、休闲旅游区和现代工业区三类功能区，并对三类功能区的功能定位和发展方向作出了阐述。具体研究内容如下:　　(1)对主体功能区划的研究背景、研究意义、国内外研究现状做出了阐述，指出了县域主体功能区划研究的必要性，并介绍了GIS技术在主体功能区划中的应用;　　(2)以南川区为实证研究对象，根据国家政策，结合南川区土地利用总体规划，对南川区现代工业区进行了试划，并对其功能定位和发展方向作出了阐述;　　(3)构建了南川区休闲旅游功能区划分评价指标体系，并在yaahp软件中应用层次分析法确定了评价指标体系的权重，定量评价了南川区休闲旅游综合适宜性，根据适宜性评价值分级划分了南川区休闲旅游区，并对其功能定位和发展方向作出了阐述;　　(4)构建了南川区耕地入选基本农田决策指标体系，并利用熵权法确定了评价指标的权重，再利用改进的TOPSIS法对耕地进行排序，得到了耕地入选基本农田最终结果，根据结果划分了生态农业功能区，并对其功能定位和发展方向作出了阐述;　　(5)对本论文的研究成果做出了总结，指出了本文的研究特色和创新之处，并对本文的不足之处及后续研究方向进行了讨论。