基于大肠癌患者生存期预测的关键生物标志物挖掘

来源 :石家庄铁道大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:vickyfucandy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大肠癌是常见的恶性肿瘤,具有高发病率和死亡率,且发病率呈上升趋势。因此,大肠癌患者的生存期预测和预后因素的研究也越来越重要。生物标志物可以准确、敏感地评价早期损害,有效的生物标志物对大肠癌患者的早期诊断、生存期预测有着重要作用。虽然传统的单变量和多变量分析方法,验证了生物标志物的重要性,但是并没有考虑到生物标志物间的相互作用。在此背景下,本文研究基于大肠癌患者生存期预测的关键生物标志物挖掘算法。本文首先介绍了大肠癌患者生存期预测的研究现状和意义,在目前研究的基础上,设计了基于患者生存期预测的关键生物标志物挖掘模型,在特定数据集上进行了应用,并设计了原型系统。主要研究内容包括:(1)大肠癌关键生物标志物挖掘模型设计:通过对混合特征选择技术及随机搜索特征选择方法的分析,确定基于特征交互作用的生物标志物挖掘模型框架。(2)基于患者离散生存期预测的关键生物标志物挖掘:针对采用的瑞典林雪平大学肿瘤科对大肠癌患者的临床数据特征、治疗特征以及生物标志物整理的数据集的特点,对比分析分类器模型,以大肠癌患者离散生存期预测为目标,构建了粒子群优化算法与朴素贝叶斯结合的标志物挖掘模型(WPSO-NB)。首先进行了生物标志物特征的重要性分析。接着分别以肠癌患者5年和3~5年生存期预测为目标,对模型进行了实验验证,其分类精度分别超过了90%和75%,证明了模型的可行性及有效性。(3)基于患者连续生存期预测的关键生物标志物挖掘:以大肠癌患者连续生存期(月份数)预测为目标,构建了粒子群优化算法结合BP神经网络的挖掘模型(WPSO-BP)并进行挖掘实验。实验结果表明,模型挖掘出的最优特征子集的预测误差远小于全部特征的预测误差,验证了WPSO-BP模型的可行性。(4)基于癌症患者生存期预测的关键生物标志物挖掘原型系统:在论文设计的混合挖掘模型的基础上,搭建了一个基于患者生存期预测的关键标志物挖掘系统,使其可以对数据进行拟合、生存期预测以及关键标志物挖掘。
其他文献
改革开放四十年来,经济高速发展的同时也使得环境质量问题日益严重,目前我国尤其是工业城市面临十分严峻的大气污染问题。实现大气数据分析和空气质量预测对环境保护部门制定政策进行空气污染治理有着重要的支撑作用。现阶段的空气质量在线监测平台仅包含简单的数据报表功能,无法有效利用环境保护部门积累的海量空气质量数据和气象因子数据进行深层次的数据分析和挖掘。现有的数据预测模型存在复杂度高、训练模型使用大气数据来源
数字化改革是浙江立足新发展阶段、贯彻新发展理念、构建新发展格局的重大战略举措,是全面深化改革的总抓手。全省数字化改革大会和全省人大数字化改革工作推进会召开以来,各级人大统一思想、迅速行动,统筹推进改革各项工作,努力打造数字人大工作新名片。  吹响人大数字化改革新号角  2021年春节上班后,全省数字化改革大会和全省人大数字化改革工作推进会相继召开,吹响了全面推进我省人大数字化改革工作的新号角。  
研究背景组织细胞的低温保存是维持细胞活力和细胞功能的重要方法。然而,常规细胞冷冻保存方法的细胞活力和功能不太理想,这可能导致细胞在冷冻保存中凋亡和坏死。海藻糖在维持细胞结构和保护细胞免受压力方面发挥作用。然而,由于海藻糖难以通过细胞膜转运,其抗冻效果受到限制。近年来,人们已经探索了许多种将海藻糖引入哺乳动物细胞的方法。其中磷灰石纳米微粒(Nanoparticles,NP)是一种理想的介导材料,其对
棉花是我国重要的经济作物之一,也是世界第二大纺织纤维工业原料和食用油原料。随着棉花基因工程和转基因育种的不断发展,转基因育种成为棉花育种最为快捷高效的途径。体细胞胚胎发生作为棉花再生体系的主要途径,具有遗传稳定性好和嵌合体少的优点,体细胞胚胎发生体系的建立是棉花高效遗传转化技术的基础。近年来,不同基因型棉花再生体系相继建立,对棉花体细胞胚胎再生体系的分子机制研究也越来越多。其中,生长素和光在体细胞
大兴安岭具有广阔的森林覆盖面积,林下有大量未被开发利用的真菌资源,其次生代谢物十分丰富。寡营养真菌是其中一类重要微生物,不仅在调节生态系统方面起着特殊作用,也同时是重要的可利用资源。我国寡营养真菌资源丰富,但是相关研究却很少。基于以上研究背景,本研究开展大兴安岭林下凋落物寡营养真菌研究,对其分类、活性及次生代谢潜力进行评价,试图获得具有深入研究潜力的活性真菌资源。本研究从大兴安岭森林采集凋落物样品
本论文运用雅克拉康的镜像理论和欲望理论研究了电影《消失的爱人》,旨在深入探究主角艾米在疯狂追寻“他者”的理想心像的过程中的异化与不在场。根据拉康的镜像理论和欲望理论可知,婴儿是在周围的语言与目光的影响下在“他者”的形象上建立起自我的。当主体进入象征界后,他会被人类社会的语言以及文化所包围,并且欲望着大他者的欲望,这时他才可以被称作一个“人”。通过这两个理论,拉康阐述了“他者”对于主体自我构建的重要
众所周知,翻译是一座文化交际的桥梁,是思想启蒙的先导,是科技进步的中介。作为跨文化交际的一种工具,科学技术突飞猛进的当今时代,翻译更加促进了各民族之间的交流,对人类文明的发展发挥着不可估量的作用。然而,基于人们所接受教育和成长环境的不同,形成了不同的表达风格和表达方式。由此,对于同一个原文著作,产生了不同的翻译文本。为了使翻译文本的表达风格、主题内容进一步贴近原文著作,人们在一定的社会条件下,遵循
英国马克思主义学者爱德华·汤普森,在史学研究中引入了文化研究方法,从文化研究视角梳理了英国工人阶级的形成史。他从传统习惯、宗教流派和生活状况等多方面多角度地描述英国工人阶级的形成史,阐述了英国工人阶级的独立性及在意识觉醒方面的各种因素。通过挖掘民众运动激进主义色彩,提出英国工人阶级内部拥有自我解放的力量。本文通过梳理英国工人阶级的形成脉络,探讨汤普森历史理论的基本性质及其所遵循的研究方法的独特之处
目的MicroRNA(miRNA)是由内源基因编码且长度在22个核苷酸左右的非编码单链RNA分子,它们在细胞中具有许多重要的调节作用。一个miRNA可以作用于多个靶基因以及多个miRNA可以
在目前,我国处于发展重要的战略机遇期,在社会主义新时代的背景下,妇联组织正在经历着一场深刻的变迁洗礼。妇联组织自成立70年以来,一直在不断的发展和改革,凭借自身特有的政治、组织和群众优势,在维护妇女利益,促进男女平等等工作中发挥着党联系妇女群众的桥梁、纽带和国家政权的重要支柱作用。但是,随着改革的不断深入,妇联组织的工作重心和服务对象发生了变化,妇女群众的利益诉求也呈现多元变化,传统的妇女工作模式